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CIP格式

此页面提供 CIP 脚本包格式类别的用户文档。

One can found additional information on the function parameters (type, optional/required, positional/named) on the 参数文档页面。

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创建

描述
this function allows to create image specifying their size, value, pixel type and name.

签名 outputImage = cip.create( size*, value, type, name)
将创建一个大小范围的图像，并使用指定的值、像素类型和名称进行初始化。 outputImage = cip.create( inputImage*, value, type, name)
将创建一个与 inputImage 大小相同的图像，并使用指定的值、像素类型和名称进行初始化。 输入 inputImage* ：一个图像，其大小将用于创建图像进程
size* ：指定要创建的图像尺寸的标量列表
value ：值一个标量，该值用于初始化新图像
type ：{‘bit’, ‘uint8’, ‘int8’, ‘uint16’, ‘int16’, ‘uint32’, ‘int32’, ‘uint64’, ‘int64’, ‘漂浮’, ‘double’}中的字符串，定义输出的像素类型。也可以使用“short”、“ushort”或“unsignedshort”等面额。
name ：用于新图像名称的字符串。 输出 outputImage ：具有指定大小、值、像素类型和名称的图像。 执行
the function wraps the ops img function in the namespace create ＃ 复制 描述
The function duplicate an input image or a crop if the input image

签名 outputImage = cip.duplicate( inputImage*, origin, size, method)
将在指定边界内复制输入图像。 输入 inputImage* ：要复制的图像
origin ：指定要复制区域的原点的标量列表。如果未提供，则使用输入图像原点
size ：指定要复制的区域范围的标量列表。如果未提供，则为每个维度选择最大值减去原点
method ：{‘deep’, ‘浅的’} 中的字符串，指定输出是否复制数据或引用输入数据。 输出 outputImage* ：复制的图像 例子 img2 = cip.duplicate( img1 , 'origin', [300,200], 'size', [150,150] ) CIP_duplicate.PNG

执行
the shallow copy is done with Views.offsetInterval in ImgLib2 and the deep copy is done with the ops function copy().rai().

切片

描述
This function reduce input image dimensionality by duplicating a region of the same size as the input except along a selected dimension where the input is duplicated only at a particular position.

签名 outputImage = cip.slice( inputImage*, dimension, position, method)
将沿指定维度在指定位置复制输入。 输入 inputImage* ：要处理的图像
维度 ：指定要切片的维度的标量或标量列表
位置 ：与维度大小相同的标量或标量列表，指示沿指定维度复制的位置。
method ：{‘deep’, ‘浅的’} 中的字符串，指定输出是否复制数据或引用输入数据。 输出 outputImage* ：复制的图像。单个维度被删除，因此图像维度实际上小于输入维度。 例子 img2 = cip.slice( img1 , 'dimension', 2, 'position', 0 ) CIP_slice.PNG

执行
The shallow copy is done with Views.offsetInterval in ImgLib2 and the deep copy also apply the ops function copy().rai(). ＃ 项目 描述
This function reduce input image dimensionality by applying an operation to all the pixel along user specified dimension(s). sum, max and ,min operation are currently implemented.

签名 valMap, argMap = cip.project( inputImage*, dimension, method, output)
使用指定方法沿指定维度创建投影图像。 输入 inputImage* ：要处理的图像
dimensions ：指定要切片的维度的标量或标量列表
位置 ：与维度大小相同的标量或标量列表，指示沿指定维度复制的位置。
output ：{‘投影’, ‘argument’, ‘both’} 中的字符串，指定输出应该是投影图像、投影的参数还是两者。如果参数构造不适用，则参数具有切片数量的值。 输出 valMap ：投影图像。单个维度被删除，因此图像维度实际上小于输入维度。
argMap ：投影的参数。即对于最大投影，例如像素值处的位置沿投影维度是最大的。 例子 img2 = cip.project( img1 , 'dimension',2 ) CIP_project.PNG

执行
The projection is implemented as part of CIP.

连接

待实施