SciJava 是一个为科学提供软件的项目合作项目 计算——在可行的情况下合作和重用代码的努力。
它也是基础软件库的集合，在此基础上 ImageJ2和Fiji已建成。
SciJava 组件集合
以下组件层是 SciJava component collection 的一部分：
- SciJava - 不特定于图像处理的基础层，包括具有强大插件框架和应用程序容器的SciJava Common共享库，以及基于其构建的插件。
- ImgLib2 - N 维图像处理的核心库。
- SCIFIO - N 维图像 I/O 的核心库。
- ImageJ2 - N 维图像处理的核心库和应用程序。
- Fiji - ImageJ 和 ImageJ2 的“包含电池”分布，捆绑了许多有助于科学图像分析的插件。
- BigDataViewer - 重新切片浏览器和 Fiji 插件，用于 TB 大小的多视图图像序列
- TrakEM2 - 斐济插件套件，用于形态数据挖掘、三维建模和图像拼接、注册、编辑和注释。
- Bio-Formats - 用于生命科学图像格式 I/O 的库和 ImageJ 插件。
该集合中的所有组件均由 SciJava 的 Bill of Materials 管理，以便下游组件更轻松地使用它们，而不会出现版本冲突。
SciJava 承诺
以下项目是 SciJava 承诺的一部分，旨在尽可能地共同努力、重用代码和协同作用：
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有关更多详细信息，请参阅Architecture和Governance页面以及SciJava website。
SciJava 常见
SciJava Common 是SciJava软件的通用库。它提供了一个插件框架，具有用于服务发现的可扩展机制，由其自己的注释处理器支持，以便可以动态加载插件。 ImageJ2 和SCIFIO 都使用它。
插件框架
首先，SciJava Common 是一个插件框架——开发高度模块化和可扩展的 Java 应用程序的基础。
插件发现
Java 类路径上的所有可用插件都会自动发现并可用。这是通过扫描文件路径META-INF/json/org.scijava.plugin.Plugin的类路径资源来完成的。此类文件由 Java 注释处理器在编译时生成，该处理器根据 Java 类上的 @Plugin 注释编写这些文件，这一想法受到 SezPoz 项目的启发。
应用程序容器
所有程序状态（例如可用插件）都可以从称为“应用程序上下文”的根对象访问。
服务
ImageJ2 将其各个部分封装为单独的“服务”，提供相关的状态功能并跟踪相关的程序状态。 net.imagej.ImageJ类的实例只不过是这些服务的集合；该实例称为“应用程序网关”。服务被定义为接口，具体实现为插件。此设计在正确的位置提供了seams，以便可以自定义和覆盖每个级别的行为。
SciJava 服务
以下是 SciJava Common 的一些主要核心服务：
- AppService - 跟踪上下文中存在的软件应用程序（SCIFIO、ImageJ2 等）。
- DisplayService - 跟踪可用显示以及活动显示，并提供创建新显示以可视化数据的方法。
- EventService - 将事件发布到event bus，并允许感兴趣的各方订阅它们。该服务提供了代码库各个部分之间通信的中心方式。
- IOService - 用于在上下文中打开和保存数据的通用工具。
- MenuService - 构建应用程序菜单结构。
- ModuleService - 跟踪可用模块，并提供执行它们的基础设施。
- ObjectService - 跟踪各种类型的可用对象，包括Dataset和Display。
- OptionsService - 用于管理程序设置的工具。
- PlatformService - 提供用于根据部署平台（操作系统、Java 版本等）扩展应用程序行为的挂钩。
- PluginService - 跟踪可用插件，并提供执行它们的基础设施（使用ModuleService）。
- ScriptService - 提供用于运行脚本和宏的实用程序。
- StatusService - 发布正在进行的操作的状态更新。
- ThreadService - 管理多线程。
- ToolService - 跟踪可用工具（将用户输入与行为绑定的逻辑）以及活动工具（在工具栏上选择）。
- UIService - 发现并启动用于与 ImageJ 交互的用户界面。
ImageJ2 服务
ImageJ2 添加的一些服务：
- DatasetService - 用于创建和管理图像数据的工具。
- ImageDisplayService - 与DisplayService类似，但专门针对ImageDisplays。
- OverlayService - 用于创建和管理图像叠加和感兴趣区域 (ROI) 的工具。
SCIFIO 服务
SCIFIO 提供多项附加服务，特别是：
- FormatService - 管理可用图像格式的服务。
菜单系统
SciJava 菜单系统分为多个层，以便更轻松地覆盖其行为或自定义其在用户界面中的外观。
模块
系统已知的每个模块（通过ModuleService）可以有一个menuPath，说明它应该位于菜单中的位置（默认情况下）。它还有一个menuRoot，说明它应该位于which菜单中，默认为APPLICATION_MENU_ROOT，指示主应用程序菜单结构。
菜单服务
MenuService负责使用menuPath和menuRoot值为系统中所有可用模块构建ShadowMenu树结构。这些树结构与 UI 无关。每menuRoot有一个ShadowMenu，可向MenuService随意请求。
用户界面
然后，UIService 负责根据可用的ShadowMenu 构建实际的特定于 UI 的菜单栏（或它想要的任何 UI 组件和/或小部件）。 MenuCreator 接口下有一个类型层次结构，旨在用于此目的；例如，SwingJMenuBarCreator 实现 MenuCreator 来创建和维护反映特定 ShadowMenu 状态的 Swing JMenuBar。
变更如何传播
当添加、删除或更改模块时（通过 ModulesAddedEvent、ModulesRemovedEvent、ModulesUpdatedEvent），MenuService 会监听并相应更新相关的 ShadowMenu。它通过触发相应事件来通知相关方已这样做：MenusAddedEvent、MenusRemovedEvent 或 MenusUpdatedEvent。
API 版本历史
API 更改历史记录可在以下位置找到：https://abi-laboratory.pro/java/tracker/timeline/scijava-common/
