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简介
图像分割是“将数字图像分割成多个片段的过程”。 (Wikipedia)

它通常用于定位对象和边界。
更准确地说,图像分割就是为图像中的每个像素“分配标签”的过程,使得具有相同标签的像素共享某些视觉特征。
#简单的工作流程
一款功能强大且易于非图像处理专家使用的插件:
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插件名称 |
简要描述 |
亮点 |
快照 |
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一种工具,将一组机器学习算法与一组选定的图像特征相结合,以生成基于像素的分割。 |
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尝试一下——您可能会喜欢它! #灵活的工作流程 ImageJ中构建了一个良好的工作流程如下:
- Preprocess给定的图像
- 申请Auto Threshold
- 创建和操作mask
- Create and transfer从蒙版到原始图像的选择
- Analyze结果数据
出售
使用过滤器对图像进行初始化,使后续阈值处理更加有效。使用哪个过滤器很大程度上取决于您的数据,但一些常用的过滤器包括:
调整阈值

Tree ring sample image with a threshold applied for a B&W image
理想情况下,您希望使用其中一种自动阈值方法,而不是手动调整,以便稍后可以在相同数据和多个其他数据集上重置您的结果。
- 打开您的图片
- 选择Edit › Selection › Create Mask
- 指定背景是还是浅色
- 调整最小和最大调整,直到您对图像的满意度满意为止
- More information
创建蒙版
- More information

Over-saturated mask is eroded around the center tree ring
- 选择Image › Adjust › Threshold… -图像根据和设置的阈值,图像的某些部分可能过渗/欠渗
- 分割重叠对象的一种快速方法是使用Watershed命令。
选择

Selections on the mask
###创建选择
- 选择Edit › Selection › Create Selection以选择蒙版内的对象
- 要取消选择的图片部分,请选择⇧ Shift + E

Selections on the reverted image
传输选择
- 在传输蒙版的选择之前,通过选择⇧ Shift +
Left Click将图像恢复原始格式 -首先选择蒙版,然后选择原始图像,然后选择⇧ Shift + E以传输蒙版的选择
对所选数据进行一些数值分析:
- 直接Measure整个选择。
- Control which measurements are done using Set Measurements.
- 使用Analyze Particles从您的选择中提取所需的对象并报告它们的个人统计数据。
- 使用ROI Manager添加选择,然后分割它(在更多按钮下),然后使用静态测量(也更多下)报告对象的统计信息。
- Write a macro自动执行此类分析、循环ROI管理器中的对象、测量和操作等。
#另请参阅
- Introduction to Image Segmentation using ImageJ/Fiji研讨会。
- Segmentation with Fiji workshop slides。
- List of extensions,ImageJ扩展列表,您可以按分割类别进行过滤。
