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TIFF

TIFF file format 是生物科学中使用最广泛的格式之一。许多商业工具使用某种 TIFF 格式来写入图像。它也用于 open source 的工作中;例如,Open Microscopy Environment制定了OME-TIFF format作为显微镜数据的开放交换标准。

ImageJ 支持

ImageJ(因此ImageJ2及其默认的旧用户界面)通过FileOpen…命令内置了对TIFF文件的支持。

您还可以通过 FileImportTIFF Virtual Stack… 命令将 TIFF 导入为 virtual stacks

  • 优点: ImageJ TIFF 阅读器速度非常快。
  • 缺点: ImageJ TIFF 支持不完整。某些有效的基线 TIFF 文件将无法正确打开。特别是,无法打开平面无序的 TIFF 文件。

生物格式

Bio-Formats 插件提供了更完整的 TIFF 导入器,可通过 FileImportBio-Formats 命令访问。

  • 优点: Bio-Formats TIFF 阅读器可以处理更多种类的 TIFF。
  • 缺点: Bio-Formats TIFF 支持速度不如 ImageJ 的 TIFF 阅读器。

科幻小说

SCIFIO库,ImageJ2的I/O库,使用从Bio-Formats项目改编的代码导入TIFF文件。因此,它与 Bio-Formats 类似,支持更广泛的 TIFF,但性能低于 ImageJ 阅读器。 SCIFIO 可通过 FileImportImage… 命令访问。

您可以通过EditOptionsImageJ2…菜单的“打开文件时使用 SCIFIO(测试版!)”复选框告诉 ImageJ2 默认使用 SCIFIO。