无头脚本

SciJava scripts被设计为独立于用户界面运行——包括headless，无用户界面。通过使用script parameters，这连接很容易。

要在无头模式下启动Fiji，请运行：

fiji --headless

默认情况下，当斐济无头运行时，它就像一个间歇程序：它只会执行请求的操作，然后退出。要无头运行脚本，请使用：

fiji --headless --run path/to/script [key1=value1,key2=value2,...]

In many cases, it is necessary to enclose the entire list of key/value pairs in single quotes, to avoid shell expansion. See the following examples.

基本运行

假设我们将以下Python脚本保存在文件中，hello.py：

#@String name
print('Hello ' + name)

我们可以使用 Linux 上的命令运行此脚本：

fiji --headless --run hello.py 'name="Mr Kraken"'

请注意，name参数必须用双引号括起来，因为它是字符串文字。

在Windows系统上，单/双引号可能会颠倒，这样字符串就用单引号括起来，而参数列表以及py脚本的路径则用双引号括起来。

fiji --headless --run "PathTo/hello.py" "name='Mr Kraken'"

在macOS系统上，该命令可以使用与Linux上相同的引用运行：

fiji --headless --run hello.py 'name="Mr Kracken"'

如果您的脚本有多个参数：

#@String name1
#@String name2
print('Hello ' + name1 + " and " + name2)

然后使用逗号分隔的参数对列表来填充它们，例如：

fiji --headless --run hello.py 'name1="Mr",name2="Mrs Kraken"'

同样，对于 Windows（同样尊重单/双引号）或 macOS，

fiji --headless --run "PathTo/hello.py" "name1='Mr', name2='Kraken'"
fiji --headless --run hello.py 'name1="Mr",name2="Mrs Kraken"'

为了防止在无头模式下不必要的服务器连接来更新站点，您可以设置imagej.updater.disableAutocheckjava参数true：

fiji -Dimagej.updater.disableAutocheck=true -- --headless --run hello.py 'name="Mr Kraken"'

通常，无头模式用于运行大量脚本，这可能会导致大量服务器连接。设置此参数可以防止此问题。此参数在启动之间不会持续存在，并且每次应阻止服务器连接到更新站点时都必须包含此参数。