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我在Scionics GmbH和位于德累斯顿的马克斯普朗克细胞分子生物学和研究所(MPI-CBG)从事图像分析咨询工作。项目重点关注光学显微镜、电子显微镜和高精度筛选数据。

Minimum Cost S surface projection

Interactive watershed

CIP: simple script for simple analysis
我开发的图像分析工具
- Manual drift correction plugin:一个简单的脚本,用于以最少的用户输入进行手动序列注册。分散数据参考点,其仪表插值将在参考点之间。
- Minimum Cost Z surface Projection提供工具和插件来检测3D数据中的2D表面。人们可以检索表面的海拔图和带有表面信号的图像。
- Interactive Watershed:处理一次分水岭,然后交互式调整其参数,同时将结果叠加到图像上。这就是这个插件的功能。它对于数据探索非常实用,是的,它可以在 3D 中工作
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CIP 用于简化 ImageJ 中脚本编写的工具箱。非常适合您在图像分析脚本编写、教学和工作流程原型设计方面迈出第一步。
imagej wiki 上描述的其他项目
- MS-ECS-2D更新网站。 A collaboration 与 MPI-CBG 的 Vastenhouw 实验室和 Myers 实验室合作
- CElegansBeadsAnalysis plugin。A collaboration 与 MPI-CBG 的 Kurzchalia 实验室合作(我的第一个 IJ 脚本/插件;-)