自迁移出 MediaWiki 以来，本页内容尚未经过审查。如果您愿意帮忙，请查看帮助指南！
此页面链接到 BigDataViewer 斐济插件的示例数据集。请参阅BigDataViewer用户指南。
最小 SPIM 示例
这是在Zeiss Lightsheet Z.1上获取的果蝇细胞在的摘录中发生了较大的多视图延迟。下载XML和HDF5文件drosophila.xml和drosophila.h5。使用斐济菜单中的Plugins › BigDataViewer › Browse BigDataServer打开XML文件。
His-YFP SPIM 示例
基于 Stephan Preibisch 的在所有细胞中表达 His-YFP 的果蝇 的结果数据集 (available here)，使用 Zeiss Demonstrator B 获取。该数据包含该七个视图数据集的一个时间点。将数据导出到 HDF5，使用 Stephan Preibsich 的 Multiview-Reconstruction 插件对数据集进行配准、融合和反对。该数据集有 9 个视图：团队的 7个原始角度、注册角度的基于内容的融合以及注册角度的多视角反驳。下载 XML 和 HDF5 文件 HisYFP-SPIM.xml 和 HisYFP-SPIM.h5。使用斐济菜单中的Plugins › BigDataViewer › Open XML/HDF5打开 XML 文件。（另外，您下载此设置文件HisYFP-SPIM.settings.xml，它可以调整聚合和去稀疏数据的黑暗。只需将其放在 HisYFP-SPIM.xml 文件附近就可以了。）
远程 HDF5
该数据集由我们的BigDataServer（仍处于测试阶段）提供。它包含在Zeiss Lightsheet Z.1上采集的大型6角度延迟果蝇独立发生的250个时间点。数据集作为500GB XML/HDF5文件存储在服务器上。对于远程查看，只需要XML文件。下载remote.xml并从斐济菜单中使用Plugins › BigDataViewer › Open XML/HDF5打开它。
或者，从斐济菜单中选择Plugins › BigDataViewer › Open XML/HDF5，浏览服务器http://tomancak-srv1.mpi-cbg.de:8081并打开Drosophila数据集。
###猫女
一果龄蝇幼虫腹神经索1.5段的电子显微镜数据集（458个切片，每个切片由约70个重叠图像块组成，以4 nm/px计算，切片厚度为50 nm）可通过基于网络浏览器的§§16§§§在线获取。
该数据集由 Janelia 农场的 Albert Cardona 收集。结论由阿尔伯特·卡多纳 (Albert Cardona) 和韦恩·佩雷亚努 (Wayne Pereanu) 完成。里克·费特 (Rick Fetter) 准备了样本，朱莉·辛普森 (Julie Simpson) 通过 HHMI Janelia 农场访问科学家计划资助了数据收集。该数据集首次在本实验室中介绍，涉及 ssTEM 弹性重建：
Saalfeld S.、Fetter R.、Cardona A.、Tomancak P. (2012) 通过一系列超薄切片进行弹性体积重建 自然方法 9(7), 717-720
这里提供数据的唯一目的是展示 BDV 的可视化功能，并严格视为“脚本查看”。
要在BigDataViewer中查看它，请下载catmaid-abd1.5.xml并使用斐济菜单中的Plugins › BigDataViewer › Open XML/HDF5打开。
