说明
BigDataServer 是一个简单的 HTTP 服务器，为 BigDataViewer Fiji 插件提供 XML/HDF5 数据集以进行可视化。
BigDataServer 在选择托管 XML/HDF5 数据集的远程计算机上运行。运行斐济的客户端连接到服务器，服务器提供的数据集，然后将数据有效地传递到 BigDataViewer。通过这种方式，无缝地导航位于远程位置的非常大的数据集。
安装并运行BigDataServer
BigDataServer 被备份为一个包含所有必需依赖项的“包含电池”的 jar 文件。它使用 Java 7 或更高版本从命令行运行。将 bigdataserver.jar 复制到您的网络服务器（可以运行 Linux）。使用以下命令运行 BigDataServer：
$ java -Xmx4G -jar bigdataserver.jar PARAMETERS
-Xmx4G选项为服务器提供了4GB RAM。服务器构建在与BigDataViewer相同的存储架构上，不需要大量RAM就可以运行（1GB或更少就足够了）。但是，因为使用更多的RAM运行意味着更多的数据可以存储在RAM中（在服务器上）。这将提高性能，可以从存储的数据中快速处理客户端请求。
运行时不带参数的上述命令将打印以下帮助：
$ java -Xmx4G -jar bigdataserver.jar
usage: BigDataServer [OPTIONS] [NAME XML] ...
Serves one or more XML/HDF5 datasets for remote access over HTTP.
Provide (NAME XML) pairs on the command line or in a dataset file, where
NAME is the name under which the dataset should be made accessible and XML
is the path to the XML file of the dataset.
-d <FILE> Dataset file: A plain text file specifying one dataset
per line. Each line is formatted as "NAME `<TAB>` XML".
-p <PORT> Listening port.
(default: 8080)
-s <HOSTNAME> Hostname of the server.
(default: localhost)
-t <DIRECTORY> Directory to store thumbnails. (new temporary directory
by default.)
启动服务器的命令典型如下所示：
$ java -Xmx4G -jar bigdataserver.jar -d datasets.txt -s fly.mpi-cbg.de -p 8081
2015-02-14 14:02:52.696:[INFO::main](INFO__main): Logging initialized @421ms
...
2015-02-14 14:03:12.316:[INFO:oejs.Server:main](INFO_oejs.Server_main): Started @20046ms
其中dataset.txt是制作表符分隔的名称列表以及本地可访问数据集的XML路径（包含XML和HDF5文件）。例如dataset.txt可能如下所示：
drosophila_original_test /mnt/export/hdf5_dataset.xml
drosophila_registered_test /mnt/export/registered_dataset.xml
服务器将继续运行，直到您使用⌃ Ctrl + A取消它或关闭shell。要在后台启动服务器，请在屏幕会话中运行它：
$ screen
$ java -Xmx4G -jar bigdataserver.jar -d datasets.txt
2015-02-14 14:02:52.696:`[`INFO::main`](INFO__main)`: Logging initialized @421ms
...
2015-02-14 14:03:12.316:[INFO:oejs.Server:main](INFO_oejs.Server_main): Started @20046ms
并使用 ⌃ Ctrl + C ⌃ Ctrl + C分离屏幕。
要添加新的数据集，请编辑 dataset.txt 并添加新的 XML 路径。之后您必须重新启动服务器。 （使用screen -r重新连接屏幕会话，使用D取消服务器并重复上述操作）。
请注意，服务器端口需要打开。
从斐济连接到正在运行的 BigDataServer
要从斐济连接到BigDataServer并查看数据，请转到Plugins › BigDataViewer › Browse BigDataServer。您将看到以下对话框：
输入 BigDataServer 的 URL（包括端口）。例如，BigDataViewer_Example_Datasets#Remote_HDF5中描述的果蝇延时数据集可通过以下地址获得：http://fly.mpi-cbg.de:8081. 单击“确定”。将弹出以下窗口，显示服务器提供的数据集列表：
在示例中，服务器仅提供一个名为 Drosophila 的数据集。双击列表中的数据集将在 BigDataViewer 中启动它。
