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如何创建宇宙图像堆栈显示为体积渲染、正交切片、等值面或矩形图
您可以下载本指南 here 的示例来源代码。
创建虚拟世界并在其中显示图像堆栈只需几个步骤。
首先要做的是打开图片库：
// Open an image
String path = "/home/bene/PhD/brains/template.tif";
ImagePlus imp = IJ.openImage(path);
new StackConverter(imp).convertToGray8();
然后创建一个虚拟宇宙并将其显示在窗口中：
// Create a universe and show it
Image3DUniverse univ = new Image3DUniverse();
univ.show();
通过以下代码行创建 3D 对象（=内容）并将其添加到 Universe：
// Add the image as a volume rendering
Content c = univ.addVoltex(imp);
在这种情况下，堆栈显示为体渲染。这里通过将堆栈的2D切片一个接一个地放置来创建体积渲染。从而根据图像的像素尺寸来分离不同的平面。根据其强度，为每个体素分配一个透明度值。因此，黑色体素是完全透明的，而白色体素是完全不透明的。
存在4种类型的内容：体积渲染、立体切片、值面和曲面图等。从ImagePlus创建的内容可以从一种显示类型转移到另一种显示类型：
// Display the image as orthslices
c.displayAs(Content.ORTHO);
正交切片是一片面的三个正交切片。
内容可以来自Universe中删除，并通过其名称进行标识：
// Remove the Content
univ.removeContent(c.getName());
这里我们将堆栈添加为等值面：
// Add an isosurface
c = univ.addMesh(imp);
等值面是通过应用移动立方体算法生成的表面。该算法假设堆栈中一个将3D物体与背景不同的强度值。因此，生成的表面理论在所有物体上都具有相同的（等）值。该值也称为表面阈值，是可调整的，稍后会看到。
最后，内容可以显示为曲面图。曲面图是 2D 形成幻灯片的 3D 表示，其中第 3 维由图像强度；
c = univ.addSurfacePlot(imp);
可以将宇宙的所有内容一起删除并关闭宇宙：
// remove all contents
univ.removeAllContents();
// close
univ.close();
Universe类处理内容的重要方法
添加新内容有以下方法：总体，这些方法有多种形式，一种是短形式，一种是长形式；长形式采用参数：
- 图片：要显示的图片
- 颜色： 新创建内容的颜色
- 名称：（唯一）名称
- 阈值：阈值，定义表面的等值
- 重采样因子：下采样因子，以加快渲染速度。
在简单的形式中，缺陷参数被设置为默认值，它们是：
- 颜色：空
- 名称：图片的标题
- 阈值： 由
Content.getDefaultThreshold()的返回值定义 - 重采样因子：由
Content.getDefaultResamplingFactor()的返回值定义 ```java public Content addContent(ImagePlus image, int type); public Content addContent(ImagePlus image, Color3f color, String name, int thresh, boolean[] channels, int resf, int type);
public Content addVoltex(ImagePlus image); public Content addVoltex(ImagePlus image, Color3f color, String name, int thresh, boolean[] channels, int resamplingF);
public Content addOrthoslice(ImagePlus image); public Content addOrthoslice(ImagePlus image, Color3f color, String name, int thresh, boolean[] channels, int resamplingF);
public Content addSurfacePlot(ImagePlus image); public Content addSurfacePlot(ImagePlus image, Color3f color, String name, int thresh, boolean[] channels, int resamplingF);
public Content addMesh(ImagePlus img); public Content addMesh(ImagePlus image, Color3f color, String name, int threshold, boolean[] channels, int resamplingF);
public Content addContent(Content c);
**删除内容**的重要方法是：
```java
public void removeAllContents();
public void removeContent(String name);
对于搜索内容，存在：
public Iterator contents();
public Collection getContents();
public Content getContent(String name);
