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重构读者

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Reconstruct Reader 插件是一个实用程序,可将 Reconstruct 项目直接转换为 TrakEM2 项目。

满足

重建项目由一个文件夹组成,其中包含一系列文件、一组剖面文件和一组图像文件。系列文件将带有 .ser 扩展名,而节文件将带有数字扩展名,例如 Project.1、Project.2、…、Project.100 等。

完全将项目转换为 TrakEM2 项目,您可以通过 Fiji 的 FileImportReconstruct Project… 对话框或通过 FileOpen… 对话框打开它。任何一个提示都会打开您的一系列文件。

日志输出将显示重建翻译器已创建,并且翻译已开始。翻译通常只需要几秒钟,但生成 mipmap 通常需要相当长的时间。

功能

Reconstruct Reader 插件的功能足以 Reconstruct 项目文件夹直接转换为单个 TrakEM2 项目 .xml 文件,然后在 TrakEM2 中打开该文件。

重建项目中不会保存任何更改。应为任何后续 TrakEM2 会话打开与项目关联的新 .xml 文件。

已知错误和问题

  • 翻译后,用户被告知 TrakEM2 已检测到崩溃。这是因为转换过程当前不会生成 TrakEM2 期望存在某些非关键文件。这并不表明存在实际问题。

联系方式

该插件的作者是Larry Lindsey