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马穆特

斐济插件,用于注释海量、多视图数据。

安装

启用Fiji updater中的MaMuT update site以获取MaMuT。

出版

doi:10.7554/eLife.34410

演示

MaMuT 是一款最终用户插件,它结合了 BigDataViewerTrackMate,提供允许浏览、注释和管理大图像数据注释的应用程序。

MaMuT_presentation.png

主窗口类似于TrackMate的显示面板。它控制注释的显示方式。使用 MaMuT Viewer 按钮,可以启动多个数据视图。他们都会同步。它们中的每一个都是 BigDataViewer 的一个实例。 Windowsinsync

我们对像谱系或随着时间给予而遵循的对象这样的注释特权(这就是TrackMate所做的)。MaMuT发布了TrackScheme,这是取自 TrackMate 的沿袭浏览器。

Withtrackscheme

然而,MaMuT 本身并不附带任何关联或跟踪算法。它适用于手动或半自动注释。尽管如此,我们还是让 GUI 足够舒适,以便您可以快速生成相当大的注释。半自动分割可以帮助从单个细胞快速生成谱系分支。

Largeannotationsquickly

用户文档

以下几页教程将引导您了解 MaMuT 并了解其功能。