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本页替换ImageJ文档中的original Image5D page。
Please consider using the built-in hyperstacks functionality in ImageJ, since it is newer and more well-integrated than this old Image5D plugin.
安装
Image5D 作为 Fiji 的一部分分发，因此除此之外不需要安装。您如果不想enable the Fiji update site，可以将Image5D JAR文件下载到plugins文件夹中，重新启动ImageJ，File › Open子菜单中就会出现新命令（New Image5D、Open Image5D等）。Image5D 需要 ImageJ 1.37b 或更高版本。
＃＃描述
这些插件将图像堆栈扩展到 5 个维度：x、y、通道（颜色）、切片 (z)、帧 (t)。与 HyperVolume Browser 不同，Image5D 具有“真正的”5D 格式。这样，在堆栈上工作的插件通常应该在当前显示的 Image5D 堆栈上按预期工作（只需尝试 z 投影即可了解这意味着什么）。 Image5D 显示在一个窗口中，该窗口在图像下方带有两个用于切片和时间的滚动条，以及一个带有控件的面板，用于更改图像右侧的当前通道及其颜色。下拉菜单允许更改通道的显示。选项包括一个灰色通道、一个彩色通道和所选通道的叠加。
在单通道颜色和瞬时模式选择下，可以打开一个面板来通道的显示颜色或使用ImageJ LUT编辑器编辑更精细的LUT。
要创建 Image5D，请使用插件“Open Series as Image5D”、“Stack to Image5D”或“RGB to Image5D”。
Open Series as Image5D 从硬盘上打开一系列图像或堆栈将其转换为 Image5D。 Stack to Image5D 将已打开的堆栈转换为 Image5D，RGB to Image5D 将 RGB 图像或堆栈转换为 Image5D。
###缺少的功能
- 保存仅保存当前堆栈，而不是完整数据集。 2.调整功能失效。 3、转换类型（8位、16位、float）失效。 4.覆盖模式下的显示变化很慢。
已知错误
样本数据
示例 5D 数据集is available。由标有 H2B-GFP 构建体的 HeLa 细胞组成，用于对荧光和染色质进行染色。大部分 GFP 荧光在帧中被染色，附加细胞经历有丝分裂。它有 2 个通道、24 个切片和 7 个帧。文件 (Spindly-GFP.zip) 包含在 ZIP 存档中的 TIFF 中。要使用 Image5D查看它，请使用Plugins › Image5D或拖放打开它，然后使用File › Open将其转换为Image5D。
还提供三重标记的克隆形成肌肉细胞的样本16-bit RGB data set。要使用Image5D查看它，请使用Plugins › Image5D › Stack to Image5D或拖放其打开，使用Plugins › Image5D › Stack to Image5D将其转换为Image5D。此图片由法国巴黎第12大学科学与技术学院的Angelica Keller博士和Juliette Peltzer博士提供。
另请参阅
历史
有关更改的详细信息，请参阅第release notes。
