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弗兰吉

_许多Frangi血管_是一种用于检测管状结构的算法(例如丝状结构(血管、神经突等)的图像)。它适用于2D和3D图像,由Frangi等人于1998年首次描述。1 (PDF)。在情况下,这种方法被认为是单图形Tubeness过滤的更好的替代方案(至少对于各向同性)图像),但该算法有两种 ImageJ 实现:

  • 旧版插件(在斐济根据ProcessFiltersFrangi Vesselnesssource code here注册)。这是一个已废弃的实现,具有预期的不准确性。

  • ImageJ Op(在斐济根据PluginsProcessFrangi Vesselness (imglib, experimental)注册)。此版本取代了以前的实现,并针对已其他实现(即 ITK 和 MATLAB)进行了验证/基准测试 (details)。它需要 3 个输入:

    1. Scale(s):要过滤的结构的主轴
    2. 像素:图像数据点之间的物理尺寸(即像素/体素尺寸)
    3. 酵母运行前是否应在每一个测量中应用高斯酵母

SNT 在内部使用此过滤器。它的Secondary Layer Wizard提供了一种预览结果中缩放尺寸效果的便捷方法。

/media/plugins/frangi-before-and-after.png

Frangi Vesselness: Left: Original image. Right: Filtered image.