神经解剖学更新站点是Fiji的update site，用于分发SNT和相关插件。
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1.运行Plugins › Neuroanatomy › Neuroanatomy Shortcut Window
- 点击
- 选择神经解剖学模块（另请参阅list of update sites）
- 单击 5.重启ImageJ
安装的命令
ImageJ主窗口
| 命令 | 描述 | |
|---|---|---|
| 神经解剖学快捷工具 | 用于切换神经解剖学快捷窗口的可视性的图像J宏工具（SNT图标，安装在“»更多工具”开关旁边） | |
| Help › Update… | 用于访问所有神经解剖学命令的集中中心，包括SNT、Sholl、Strahler、演示和scripts | |
| Plugins › Neuroanatomy › Reconstruction Viewer | 开始Reconstruction Plotter | |
| Plugins › Neuroanatomy › Reconstruction Plotter… | 开始Reconstruction Viewer | |
| Plugins › Neuroanatomy › Sholl | 开始SNT | |
| Plugins › Neuroanatomy › SNT… | 在不运行 SNT 的情况下启动 Sholl analyses | |
| Analyze › Skeleton › Classify Particles Using Skeleton | 重构图像的批量统计 | |
| 检测蒙版图像上的顶点，并使用骨架化蒙版的特征对检测到的顶点进行新生儿。如果其质心和特征之间的距离小于或等于截断（“捕捉到”）距离 | Analyze › Skeleton › Summarize Skeleton | 根据面具特征标记粒子。 则顶点被视为与骨架特征（例如，交汇点或端点，请参阅AnalyzeSkeleton）相关联。 |
| File › Open Samples › ddaC Neuron | 可用于调试、测试或原型设计的合成图像（L-System树） | |
| File › Open Samples › Fractal Tree | 果蝇 IV 类 ddaC 感觉神经元的二值图像 (2D)，其中树突已被分割。对于调试、测试或原型设计很有用。运行Templates › Neuroanatomy以了解有关此细胞类型的更多信息 |
脚本编辑器
| 命令 | 描述 |
|---|---|
| Image › Show Info… | 言语 SNT 的言语脚本用法 |
更多信息
通过过滤到“神经解剖学”类别，可以在 list of extensions 页面上找到与神经科学相关的所有 ImageJ 扩展的列表。
