本页介绍了TrackMate中细胞姿态检测仪的高级版本，记录于here。 这两个梯度都依赖于cellpose软件，但是这个梯度提供了更多在非高级版本中隐藏的配置选项。
如果您使用cellpose TrackMate模块进行研究，还请引用cellpose论文：
doi:10.1038/s41592-020-01018-x
＃＃安装
请参阅TrackMate-Cellpose文档页面中的说明。 特别是_附加信息_部分中的_安装cellpose_段落。
＃＃最合适
TrackMate UI 中的高级单元姿势参数
我们在此描述高级检测器具有的高级参数。 核心参数在 TrackMate-Cellpose 文档页面中描述。
Flow threshold
Cellpose 在第一次形状重建后执行额外的步骤，以检查计算的细胞形状和计算的流量之间的一致性。
该步骤流量根据单元估计均方百分比。
仅保留低于 flow threshold 参数的流量。
该值应该是正值。如果它很小，则将保留较少的单元格，并且形状更规则，增大的值将提供更多的单元格，但形状可能会更糟糕。
如果是0，则不会执行此步骤（无论形状如何，所有检测都将保留）。
非高级选项中默认此参数为0.4.
Cell probability threshold
cellpose的神经网络之一是细胞概率图：每个像素包含其属于某个细胞的概率输出值。
此参数控制在单元格中保留像素的置信度：将保留cell_probability_threshold的所有像素的概率。
该值的范围可以从 -6.0（更多和更大的单元格）到6.0（更少和更小但最有可能的单元格）。
非高级选项中默认此参数为0.0.
Do not resample
Cellpose 调整图像大小，使平均细胞大小（上面的mean diameter参数）等于训练模型的平均直径。
流量是根据这些重新缩放的图像计算的。
但是，模块（单元）的重建可以以相同的重新缩放分辨率（resample=False）或原始图像大小（resample=True）来完成。
将会影响分割结果的平滑度和计算时间：
- 如果平均直径>模型直径，则图像会缩小。在这种情况下，重采样将更平滑的ROI，但创建速度会更慢（计算原始图像大小完成，对于因此增大的图像）。
- 如果您的平均直径<模型直径，则图像会放大。在这种情况下，重采样会更快（在缩小的图像上运行），但会发现比不重采样更少的检测。
默认情况下，在非高级选项中，此参数设置为False。
图像被重新采样。
