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Puncta Process ImageJ 插件是一款用于计算 3D 图像数据中的浮动的 practical analysis 工具。
该插件使用单通道数据产生三个特定值：
- 点状体积对象乘以z、y和z调整的体素（体积图像元素）的平均数量。
- 呈现数量 给定 ROI（感兴趣区域）内的平均呈现数量
- ROI强度 测量感兴趣的区域的整体像素强度
Puncta Process 期望选择 ROI 的修复步骤已经完成，并且图像数据被基于索引的目录结构拆分 (488, 561)
Puncta Process 利用MorphoLibJ 和3D Objects Counter 插件，并允许用户在流程执行之前选择过滤器选项和阈值级别。
该流程提供每个流程步骤的详细输出，包括：
- 白高帽校正图像
- 3D 对象组成详细信息 (CSV)
- Z投影图像（最大强度）
摘要输出包括：
- MS Excel 报告
- 带上托盘条的视觉可视化条形图
- 摘要CSV数据（促进导入下游流程）
安装
- 在Fiji)中，您只需将 add Puncta Process 和 IJPB 插件站点添加到您的更新站点列表中：
- Select Help › Update… from the menu to start the updater.
- Click on Manage update sites. This brings up a dialog where you can activate additional update sites.
- Activate the Puncta Process and IJPB-plugins sites and close the dialog.
- Click Apply changes and restart ImageJ.
资源
主要来源代码目录位于GitHub上的here下。
截图
