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简介
MyofibrilJ 插件提供了两种脚本来分析原纤维形态。给定提取纤维的脚本图像，脚本可以测量肌原纤维的尺寸和肌节的长度。这些脚本最初是为了分析用罗丹明-鬼笔环肽染色的肌原纤维的长度和安东尼面而开发的。
满足
提供两个不同的命令，横向分析肌原纤维和纵向分析肌原纤维，分别用于分析纤维的筋面和纵向部分。在这两种情况下：
- 打开一张网格张显示图像进行分析，所有仅显示原纤维的纵向或仅显示原纤维的颈部面
- 对于每个多通道或堆栈图像，显示感兴趣的切片和通道。（任选）较差的 ROI 以聚焦图像的一部分（建议排除空白区域）
- 启动特定于所显示图像的脚本
该脚本将处理所有图像并生成一个包含结果的表格以及一些控制图像
注意：分析纵向图形时，原纤维需要水平对齐。如果没有显示水平，请在分析前旋转图。
详细信息
###纵向剖面
通过傅立叶分析来估计肌长度节。由于肌节组织的周期，傅里叶变换理论的水平轴上的周期峰的位置与肌节的长度严格相关。原纤维的厚度以两种不同的方式估计。通过测量垂直分布强度中第一个部分的位置，从自相关图像中获得一个估计值。另外，在原始图像中测量多个原纤维的接面的宽度并将其组合提供额外的平均宽度。
紧张面
原纤维直径的最终确定是通过自相关图像的预估计准确中的第一个来获得的，而它们的位置是通过检查强度来确定的。该估计用于确定图像中所有恐面周围的最佳范围。然后从图像中确定所有检测到的原纤维尺寸面，估计的尺寸与最终直径估计成比例，并组合确定原纤维的无噪声平均表示。直径根据该梯度干燥的全宽度，其中强度为最大范围的26%。除直径以外，原纤维的噪音水平还通过最近邻分析来表征，并通过最近邻指数(NNI)进行总结。
参考文献
安装
安装 MyofibrilJ 最简单的方法是通过 adding 其更新站点。具体来说：
- 启动斐济并转到菜单Help › Update…
- 打开ImageJ Updater对话框窗口后，单击管理更新站点按钮
- 单击站点管理对话框中的“添加更新站点”按钮，列表将出现一个新的空行
- 在名称栏，填写选择的名称，例如肌原纤维
- 在 URL 列中，输入 http://sites.imagej.net/MyofibrilJ/
- 在行首标记复选按钮，以便订阅
- 单击关闭按钮，然后单击应用更改
- 更新过程完成后，关闭Fji并重新打开它。现在，您可以从主菜单中选择MyofibrilJ并启动可用的脚本之一。
许可证
该程序是免费软件；您可以根据第 §§2§§§ 发布的 GNU 通用公共许可证条款重新分发和/或修改它。分发此程序的目的是希望它有用，但不提供任何保证；甚至没有适用性或特定用途适用性的默示保证。有关更多详细信息，请参阅 GNU 通用公共许可证。
