＃＃抽象的 Labkit 是一个用户友好的斐济插件，用于显微镜图像数据的分割。 它提供易于使用的手动和自动图像分割例程，可以快速应用于单通道和多通道图像以及 2D 或 3D 延时电影。 Labkit 专为高效处理大图像数据而设计，消费类笔记本电脑的用户可以方便地处理数 TB 的大图像数据。这种效率是通过使用 Imglib2 和 BigDataViewer 作为我们软件的基础来实现的。此外，还实现了基于怀卡托知识分析环境 (WEKA) 的内存高效和快速随机森林像素分类，可以选择利用图形处理单元 (GPU) 的强大功能来获得额外的性能，甚至可以在高性能计算集群 (HPC) 上用于大图像数据的分布式处理。最后，还提供了用于真实注释的手动工具。
它看起来像什么
安装
Labkit与斐济批量销售。您需要做的就是install Fiji。您可以在主菜单第Plugins > Labkit下找到Labkit。
教程
- Automatic segmentation (Quick start tutorial)
- Manual segmentation (Quick start tutorial)
- Curation of segmentation results
- How to improve automatic segmentation results?
- GPU acceleration
- Using Labkit in ImageJ Macro
- How to run Labkit on an HPC cluster to process huge data?
文档
如何引用
如果您发现 Labkit 对您的研究有用，请引用它：
