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JFilament 是一个 ImageJ 插件,用于分割和跟踪阵列图像中的 2D 和 3D 灯丝。 Jfilament 中使用的主要算法是“轴向开放活动模拟”。
相关用户说明,请参见http://athena.physics.lehigh.edu/jfilament.
此次工作得到了美国国家卫生研究院和里哈伊大学生物系统动力学夏季研究所的支持。
该代码由 Matt Smith 开发,melkor@orangepalantir.org
参考文献:
M.B.史密斯、H.李、T.沉、X.黄、E. Yusuf 和 D. Vavylonis,“使用开放活动对细胞重建丝进行分割和跟踪”,Cytosculpt 67:693-705 (2010) 1
H.李、T.沉、M. B.史密斯、I.藤原、D. Vavylonis 和 X. Huang,“基于开放主动模型的自动肌动蛋白丝分割、跟踪和尖端伸长测量”,中论文。 IEEE 国际生物医学意义研讨会:从纳米到宏观,ISBI-09,波士顿,2009 年2