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File › Open…子菜单
使用 File › Import 菜单项即可使用上市的大多数命令，特别是 Fiji 扩展（通过 ImageJ 的HandleExtraFileTypes 功能）。
内置格式
济斐主要使用 TIFF 作为图像文件格式。菜单File › Open将 TIFF 格式保存。菜单命令File › Save将打开 TIFF 并导入许多文件导入其他常见文件格式（如 JPEG、GIF、BMP、PGM、PNG）以及下面详细介绍的文件格式。文件也可以拖放到工具栏上以打开它们。
生物格式
可以通过斐济插件导入更多文件格式。有一个名为Bio-Formats的插件。这将导入和导出多种文件格式菜单及其重要元数据。它们可以通过命令File › Open直接插件访问，或者通过File › Import › Bio-Formats菜单命令相互访问，如果需要，将使用Bio-Formats。请参阅Bio-Formats网站上的§§§完整17§§§以获取列表（随后本文时为135）。
如果使用生物格式，系统会为您显示一个大对话框提示，并记住您的偏好。
将图像文件拖放到斐济工具栏将有效打开该文件，与File › Import › LSM.命令相同。
某些图像文件格式更类似于数据库而不是（图像例如 Leica LIF 文件）。在这些情况下，第二个对话框将列出“数据库”中的图像，提示您选择要打开的图像。
有几种不同的生物格式命令可用于将数据导入斐济：
- 生物格式远程选择导入器。为此，图像不必保存到您的计算机或磁盘上。但这是一个有限的功能；下载文件然后使用常规生物格式会更可靠。
- 生物格式无窗口导入器。使用此选项，斐济将使用之前生物格式的设置，因此它会在开始时跳过所有对话框。
- 您的生物格式导入器。如果需要更改导入图像的设置，请选择此命令。
蔡司 LSM 面板
您的 LSM 面板插件复制了 LOCI Bio-Format Importer 的 Zeiss LSM 文件导入功能，但通过广泛编目 LSM 元数据。 LSM Toolbox 由命令File › Open激活一旦选择 LSM，面板就会出现。
图像打开为 8 位彩色图像，具有来自 LSM 采集软件的“无调色板”α色彩。每个通道都作为单独的图像/堆栈导入。因此，Lambda 堆栈会作为多个图像导入，而不是单个堆栈。使用命令菜单可以将它们转换为堆栈：File › Import › Image Sequence.
打开后，可以访问文件信息，并且可以将信息不可逆地标记到图像中或导出。
一个文件夹中的多个文件
使用 Perkin Elmer 的 UltraVIEW 或 Scion Image 的延迟宏等软件采集的实验的每个时间点都由采集软件保存为单个 TIF。实验序列可以通过菜单命令§§9§§§导入到斐济
找到该目录，单击序列中的第一个图像，然后单击“确定”所有对话框。（当 Fiji 尝试打开实验目录中的任何非图像文件时，您可能会收到一些错误消息。）堆栈将“交错”通道记录您的多个，并且可以通过 Image › Stacks › Images to stack. 去交错
可以使用Plugins › Stacks - Shuffling › Deinterleave将不同尺寸的所选图像作为单独的图像窗口导入，然后选择要单独导入到斐济的每个图像。然后，您可以通过File › Import将这些图像堆栈中。与Image › Stacks › Images to stack函数不同，图像不需要具有相同的尺寸。如果内存有限，堆栈作为虚拟堆栈打开，其中大部分堆栈可以保留在磁盘上，直到需要堆栈。
文件夹中的多RAW序列
为了形成图像，斐济需要知道图像的尺寸、位深度、每个文件的切片数量以及文件格式中的任何相关信息（偏移量和标题大小）。您真正需要告诉它图像的 x 和 y 尺寸。这些值应该可以从获取图像的软件中获得。掌握此信息后，请按照以下步骤操作：
1.File › Import › Image Sequence 2.选择实验目录。 3.该对话框的典型值为： - Image type = 16-bit unsigned (or 8 bit typically) - Width and height as determined earlier - Offset = 0, number of image = 1, gap = 0, ‘white’ is zero = off - ‘Little-endian byte order’ = on, ‘open all files in folder’ = on to open all files in folder. 图像非也会被打开，并且可能显示为空白图像并需要删除：File › Import › Raw…。该堆栈将“交错”您录制的多个通道，并且可以通过Image › Stacks › Delete slice去交错。
AVI 和 MOV 文件
有插件可以打开未压缩的两个 AVI 和某些类型的 MOV 文件。 AVI 可以通过 Plugins › Stacks - Shuffling › DeInterleave 打开
其他导入功能
动画 GIF - 插件以 RGB 堆栈的形式打开动画 GIF 文件。还可以打开单个 GIF 图像。
斐济扩展
- Amira…：以堆栈形式打开Amira (.am)标签和图像堆栈文件。
- Biorad…：打开Biorad (.pic) 共焦堆栈。
- Psychomorph .tem 阅读器
- 显示Amira Surface：在3D窗口中打开Amira .surf表面文件（3D网格）。
- DF3…：打开POV-Ray density file。
- MRC Leginon …：打开由Leginon（桌面电子显微镜自动分析软件）生成的.mrc图像（8、16和32）位。
- PDF …：打开.pdf文件。（任选）指定哪个页面（或全部）以及比例（从100%到1000%）。请注意，从File › Import › AVI、File › Open或从
ij.io.Opener().open()方法调用打开时，此插件默认情况下将以100%放大倍率打开所有页面。 - Extract Images From PDF…：以原始分辨率从PDF文件中提取所有图像。
- DAT EMMENU …：从EMMENU软件打开.dat图像文件，以便使用SUV电子显微镜进行成像。
- DM3 Reader…：从 Gatan 相机打开 .dm3 图像文件及其所有元数据（强大电子显微镜）。
- TorstenRaw GZ Reader…：打开第http://flybrain.stanford.edu/注册工具生成的文件
- IPLab读卡器…
- 动画Gif…：以堆栈形式打开动画.gif文件。
- Amira as TrakEM2…：将 amira .am 图像堆栈文件作为 TrakEM2 项目打开。将要求提供标签文件。所有原理和参数的设置都是为了简化流程。
- 分析…
- Show LSM Toolbox：打开LSM工具箱窗口，可以打开LSM文件、以多维度查看、剪辑、直接检查其元数据、时间和z标记等。
