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FPBioimage 是一种用于在网络浏览器中查看体积数据的交互式工具。为了使用 FPBioimage 与您的协作者快速共享 3D 数据，我们为 ImageJ 和 Fiji 提供了这个有用的插件。
安装
将 FPBioimage 添加到您的“更新”站点：
1.从帮助菜单中选择更新来启动更新程序。
2.点击管理更新站点按钮。
3.勾选FPBioimage框：
4.点击关闭按钮。现在应该要安装更新程序或更新一些文件：
5.点击应用更改按钮。
6.出现提示时重新启动Fiji。
手动安装
如果您想手动安装 FPBioimage，须将 .jar release 复制到 Fiji/plugins 文件夹。
满足
FPBioimage Helper 将出现在 ImageJ 的 插件 菜单下。打开堆栈图像，然后单击它来运行插件！
请注意，为了确保颜色在 Web 应用程序中正确显示，图像必须为 RGB 类型。您可以通过从菜单中选择来更改图像类型：Image › Properties…。
FPBioimage Helper 图像分布属性Image › Type › RGB Color中设置 XYZ 体素不同，但是您可以在插件中覆盖数据此其不正确。
一键宏
将以下宏复制到Fiji/macros/StartupMacros.fiji.ijm文件底部，添加一个宏按钮，用于一键上传到FPBioimage。
macro "FPB Upload Action Tool - C111F00ffCeeeD21D24D71D81Dc1Dd1De1CfffL3137L393eL4161L4464D49D4bD4eD59D5bD5eD6aD6cD6dL9197D99D9bD9cDa1Da4Db1Db4DbbDc2Dc3DcaDccDdb" {
rW = getWidth();
rH = getHeight();
t = getTitle();
index = indexOf(t, ' ');
if (index>-1){t = substring(t, 0, index);}
index = indexOf(t, '.');
if (index>-1){t = substring(t, 0, index);}
if (rW>500){rW = 499;}
if (rH>500){rH = 499;}
getVoxelSize(vW, vH, vD, x);
run("FPBioimage Helper", "unique=" + t + " x-voxel=" +vW + " y-voxel=" + vH + " z-voxel=" + vD + " x-resolution=" + rW + " y-resolution=" + rH + " upload");
}
来源代码
FPBioimage Fiji 插件的来源代码为 on GitHub。
还可以访问 FPBioimage Web 应用程序的源代码on GitHub。
出版
- Fantham, M. 和 Kaminski, C.F. （2017）。A new online tool for visualization of volumetric data。自然光子学，11（2），69。
