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椭圆分割

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info

文件

ij-ellipsesplit.jar [1 ]

来源

Github [2 ]


目的

结构简单 结构可以用结构简单的二进制对象来实现。所使用的结构简单是在

A。菲茨吉本、M. Pilu 和 R. B. Fisher,“毁灭的直接最小二乘游艇”,IEEE Trans。模式展望。马赫。剧本,卷。21、没有。5,第 476–480 页,1999 年 5 月。

这里我们使用了BoneJ的实现。

简洁的插件的一般做法如下:

1.给定二进制输入图像I 2.然后使用ImageJ的分水岭方法对ImageW进行分割

  1. I和W异或得到所有分水岭线L 4.使用ijblob提取W中的所有自定义 5.删除与L相邻的共同部分
  2. 将简单的设计到每个最终的部分
  3. 如果可能的话合并精简号 8.通过几何图形分割平面

示例

假设您有以下输入图像:

Ellipsesplit_input.png

那么分水岭方法 (ProcessBinaryWatershed) 将给出以下结果: Ellipsesplit watershed 应用于输入图像的椭圆分割插件将结合分水岭结果和直接椭圆拟合。这导致以下结果: Ellipsesplit result

另外,它还输出几个重要的特征: Ellipsesplit resultstable

参数

ellipsesplit

GUI of Ellipse Split Plugin

二进制分割图像:如果设置为“使用标准分水岭”,就会使用 ImageJ 的分水岭技术来分割二进制对象。如果有更好的分割技术可用,您可以在此处选择通过该技术分割的二值图像。

添加到管理器:(正确/错误)如果为true,则按下号将添加到ROI管理器。

添加到结果表:(正确/错误)如果为真,则简单的一些几何特征将添加到结果表中。

重叠阈值(%):如果过度图像分割,两个重叠可能属于同一个真实对象。如果是这种情况,则重叠很可能严重重叠。在这些情况下,省略号将被合并。以%为单位的重叠阈值是一个重叠另一个重叠的分割。

长轴长度:长轴的长度。

短轴长度:短轴的长度。

纵横比: 长轴长度与短轴长度的差别。

安装

打开Biomedgroup update site,其中包括分散分割插件。

如果您使用 ImageJ,只需将 ij-ellipessplit.jar 文件复制到您的插件文件夹中,然后将 GPCJ 2.2.0 和最新的ij-blob jar 文件复制到plugins/jars 文件夹中。

如何引用

请在此处获取此插件的最新 DOI:https://zenodo.org/badge/latestdoi/18649/thorstenwagner/ij-ellipsesplit