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弹性纤维

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概述

Elastix 是一个斐济插件,将 elastix 包装到图形用户界面中。 elastix 是常用于解决图像配准问题的算法集合。支持 2D 和 3D 以及多通道注册。支持多种刚性(平移、欧拉、相似性和射像)以及局部可变形(BSpline)配准。欲了解更多信息,请访问 GitHub §§2§§§。

安装

Elastix可从ImageJ更新站点获取:http://sites.imagej.net/EMBL-CBA.

有关如何安装更新站点的详细信息,请单击here

要使用此插件,您还需要安装 elastix 本身,如here所述。

要在 ImageJ 中启动 Elastix,请从主菜单中选择 PluginsRegistrationElastixElastix

引文

您可以像这样引用这个插件:

- C.蒂舍尔(2019)。 ElastixWrapper:斐济插件,用于使用 elastix 进行 3D 图像配准。泽诺多. http://doi.org/10.5281/zenodo.2602549

另请引用原始的elastix软件:

- S.克莱因、M.凝视、K.墨菲、文学硕士维尔热弗、J.P.W. Pluim,“elastix:基于强度的医学图像配准工具箱”,IEEE Transactions on Medical Imaging,卷。29、没有。1,第196 - 205页,2010年1月。

-D.P.沙莫宁,E.E.布朗,B.P.F.莱利维尔特、M.斯密茨、S. Klein 和 M. Staring,“CPU 和 GPU 上的快速耗材图像配准用于阿尔茨海默病的诊断分类”,神经信息学前沿,卷。7、没有。50,第 1-15 页,2014 年 1 月。