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轮廓线

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info

文件

ContourLines_.jar

来源

github


插件在图像顶部生成等定制线(使用覆盖)。基于/受 anvakathis publicationstreamlines 项目启示(用于引用)。

CL2

参数

插件启动后,将出现渲染参数窗口

CL parameters dialog

###平滑半径

为了找到“的护理场”,插件计算图像与*x*和*y*中的第§§19§§§的图像,估计每个点的强度梯度。您可以指定平滑半径(高斯的SD)。值越大,可用的小强度就少。例如,这里有两张,左边一张是平滑补充2.0构建的,右边一张是用平滑补充10.0构建的。

Smoothing 2 line 0.05 distance 3 Smoothing 10 line 0.05 distance 3

请注意,右上角的小点“消失”了。

线路整合步骤

该参数定义了生成实例程如何精确地遵循图像的积分步长。值越小,生成线越精确,但生成生成线的时间也越长。下面的示例说明了 0.05(左)与 0.5 像素(右)的积分步长。

Smoothing 2 line 0.05 distance 3 Smoothing 2 line 0.5 distance 3

线之间的距离

现在,您需要等高线的密度如何。左图为3像素,右图为10像素。

Smoothing 2 line 0.05 distance 3 Smoothing 2 line 0.05 distance 10

在距离的一部分处停止线

该参数是前一个参数的一部分,它规定了停止时的线路积分。IE。每条线的终止与现有线的距离不能小于此距离。例如,右边图像参数值为0.5,右边图像参数值为0.1。

Smoothing 2 line 0.05 distance 3 x Smoothing 2 line 0.05 distance 3 single color end 0.1

使用宽带

选中此选项后,插件将使用当前的颜色(在工具栏或颜色选择器中)来选择线条构建。示例:

Smoothing 2 line 0.05 distance 3 single color

使用颜色查找表 (LUT)

插件将使用已安装的 ImageJ/Fiji 查找表 (LUT) 之一对每个其平均强度进行颜色编码。请注意,当前的最小和最大强度加权图像的“亮度/读数”设置中获取。如果您的图像使用“从暗到亮”LUT 并且您选中了对应的“选项” LUT”选项,则效果会更好。在这种情况下,较亮的线条将位于暗图像区域的顶部这种,反之亦然。在下面的示例中,左图像使用食物的“热”LUT 作为组合,而右图像的则为 LUT 未食物。

Smoothing 2 line 0.05 distance 3 Smoothing 2 line 0.05 distance 3 not inverted thermal

删除开放

插件将删除开放单一(具有自由端的单一)。如下所示,左图像包含开放单一,而右图像则不包含。

Smoothing 2 line 0.05 distance 3 x Smoothing 2 line 0.05 distance 3 single color closed only

更新历史记录

  • v.0.0.4 添加了线路集成结束的标准。添加了删除开放可能的可能性。