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米亚

Release DOI

MIA(元数据检查分析器)是一款专业的、用户友好的ImageJ/Fiji插件,专为即时提取和可视化细胞元数据而设计。

博士开发。中国科学院脑科学与智能技术卓越中心(CEBSIT)的王奎表示,它填补了基本文件信息和复杂OME-XML解析之间的空白,为生物学家提供了“拖放式”解决方案。

作者:Kui Wang,CEBSIT,CAS。如有疑问,请使用 image.sc 上的 GitHub Issues 或标签@Epivitae。

主要特点

  • 即时检查:只需拖放任何解剖文件即可立即查看尺寸(XYZT)、像素大小和时间间隔,而无需打开完整图像。
  • 深度提取
    • Olympus (.oir): Advanced parsing of proprietary tags often hidden by standard readers (e.g., Exact Laser Lines, Emission Ranges, Real-Time Intervals).
    • General (.czi, .lif, .nd2): Full standard OME-XML support via Bio-Formats integration.
  • 光谱映射:自动激发/发射波长的颜色编码生成标签(例如,●Ex488),使通道识别稀疏费力。
  • 一键式报告:导出完整的CSV报告(兼容Excel),其中包含摘要和完整的原始元数据树以进行数据审核。

安装与更新

MIA通过生物传感器工具斐济更新站点分配。

1.打开斐济/ImageJ

  1. 导航至 帮助 › 更新… 3.点击“管理更新站点”。
  2. 从列表中选中生物传感器工具。 5.点击“应用并关闭”,然后重新启动Fiji。

If the site is missing from the list, you can add it manually:
Name: Biosensor Tools
URL: https://sites.imagej.net/Biosensor-Tools/

使用工作流程

  1. 启动:通过Plugins › Biosensor Tools › MIA启动插件。
  2. 检查:将尸体文件(.oir.czi.nd2等)直接拖放到面板中。
  3. 查看:检查关键参数摘要以快速获取详细信息。
  4. 导出:单击“导出报告”将所有元保存数据到本地CSV文件,以供实验室笔记本或图书使用。

引文和 DOI

如果您在研究中使用该软件,请引用该软件和存储库:

王K.(2026)。 MIA:元数据检查分析器-用于提取队伍源参数的轻量级工具(v1.1.0)。泽诺多. 王K.(2026)。 https://doi.org/10.5281/zenodo.18280807


由 Kui Wang 开发 © 2026。生物传感器工具套件的一部分,专为基因编码指标和神经化学分析而开发。