MIA(元数据检查分析器)是一款专业的、用户友好的ImageJ/Fiji插件,专为即时提取和可视化细胞元数据而设计。
由博士开发。中国科学院脑科学与智能技术卓越中心(CEBSIT)的王奎表示,它填补了基本文件信息和复杂OME-XML解析之间的空白,为生物学家提供了“拖放式”解决方案。
作者:Kui Wang,CEBSIT,CAS。如有疑问,请使用 image.sc 上的 GitHub Issues 或标签@Epivitae。
主要特点
- 即时检查:只需拖放任何解剖文件即可立即查看尺寸(XYZT)、像素大小和时间间隔,而无需打开完整图像。
- 深度提取:
- Olympus (.oir): Advanced parsing of proprietary tags often hidden by standard readers (e.g., Exact Laser Lines, Emission Ranges, Real-Time Intervals).
- General (.czi, .lif, .nd2): Full standard OME-XML support via Bio-Formats integration.
- 光谱映射:自动激发/发射波长的颜色编码生成标签(例如,●Ex488),使通道识别稀疏费力。
- 一键式报告:导出完整的CSV报告(兼容Excel),其中包含摘要和完整的原始元数据树以进行数据审核。
安装与更新
MIA通过生物传感器工具斐济更新站点分配。
1.打开斐济/ImageJ。
- 导航至 帮助 › 更新… 3.点击“管理更新站点”。
- 从列表中选中生物传感器工具。 5.点击“应用并关闭”,然后重新启动Fiji。
If the site is missing from the list, you can add it manually:
Name: Biosensor Tools
URL: https://sites.imagej.net/Biosensor-Tools/
使用工作流程
- 启动:通过
Plugins › Biosensor Tools › MIA启动插件。 - 检查:将尸体文件(
.oir、.czi、.nd2等)直接拖放到面板中。 - 查看:检查关键参数摘要以快速获取详细信息。
- 导出:单击“导出报告”将所有元保存数据到本地CSV文件,以供实验室笔记本或图书使用。
引文和 DOI
如果您在研究中使用该软件,请引用该软件和存储库:
王K.(2026)。 MIA:元数据检查分析器-用于提取队伍源参数的轻量级工具(v1.1.0)。泽诺多. 王K.(2026)。 https://doi.org/10.5281/zenodo.18280807
由 Kui Wang 开发 © 2026。生物传感器工具套件的一部分,专为基因编码指标和神经化学分析而开发。