我是中科院神经科学研究所(ION)的博士后研究员,领导Chimeric Nano Sensor (CNS) Team。我的研究重点是基因编码序列生物传感器的开发其研究活体动物神经化学在动力学中的应用。
🔬 生物传感器工具
我开发了 Biosensor Tools,这是一套开源 ImageJ/Fiji 插件,专注于推理、运动校正、元数据检查和人工智能驱动去噪声而设计。
📥 安装
安装和保持最新状态的最简单方法是通过斐济更新站点:
1.开放斐济并导航至Help > Update...
- 单击
Manage update sites。 3.点击Add update site并输入:- 姓名:
Biosensor Tools - 网址:
https://sites.imagej.net/Biosensor-Tools/
- 姓名:
- 关闭窗口并单击
Apply changes。
🛠️ 插件列表
| 插件 | 描述 | 友情链接 | | :— | :— | :— | | RIA-J
(不同逻辑分析仪)| 出版级数据分析。
具有背景像素、逐像素数据计算和IMD显示模式。 Wiki GitHub DOI| | FIA
(指纹导入器)| 运动校正和配准。
在量化之前稳定活体动物延迟数据集(和全局密集流)。 Wiki GitHub DOI | | NIA
(神经推理助手)| 零设置AI加载。
通过ONNX运行时直接在Java中运行深度学习模型(DnCNN)。耗Python,耗CUDA。支持5D超栈。 | Wiki GitHub DOI | | MIA
(元数据检查分析器)| 元数据浏览器。
即时提取隐藏标签(Olympus .oir、OME-XML)并将摘要导出到 Excel/CSV。 |Wiki GitHub DOI | | WinMan§§§23§§§(窗口管理器)| 工作区加速器。§§§24§§§有效管理、平铺和过滤多个图像窗口,以保持工作区整洁。 | §§§12§§§ §§§13§§§ §§§14§§§ |