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3D 对象计数器

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它有什么作用?

这个插件:

  • 计算堆栈中3D对象的数量。
  • 对每个找到的对象量化以下参数:
    • Integrated density;
    • Mean of the gray values;
    • Standard deviation of the gray values;
    • Minimum gray value;
    • Maximum gray value;
    • Median of the gray values;
    • Mean distance from the geometrical centre of the object to surface;
    • Standard deviation of the distance to surface;
    • Median distance to surface;
    • Centroid;
    • Centre of mass;
    • Bounding box.
  • 生成结果表示,例如:
    • Objects’ map;
    • Surface voxels’ map;
    • Centroids’ map;
    • Centres of masses’ map. 与 ImageJ 的“分析工具”功能一样,3D-OC 还具有“重定向到”选项,允许将图像模拟器作为来计算第二幅图像上的强度相关参数。

插件手册

该插件的手册可以从 ImageJ’s wiki. 下载

安装/更新

v2.0 插件现已包含在斐济;只需使用 HelpUpdate Fiji 即可获得。

参考

原始插件发布在这里:S. Bolte & F. P. Cordelières, A guided tour into subcellular colocalization analysis in light microscopy, Journal of Microscopy, Volume 224, Issue 3: 213-232

许可证

该是免费软件;您可以根据自由软件基金会发布的 GNU 通用公共许可证的条款重新分发和/或许可程序;的版本 3,或(由您提供)任何更高版本。分发此程序的目的是有用的,但不做任何保证;甚至没有适销性或特定用途适用性的默示保证。有关更多希望详细信息,请参阅 GNU 通用公共许可证。您应该随程序一起收到 GNU 通用许可证公共副本。如果没有,请参阅http://www.gnu.org/licenses/