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3D 滤镜

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3D 颈部

使用终端球邻域进行3D过滤,作为3D ImageJ Suite的一部分。

作者

Thomas Boudier

Matthias Labschütz 贡献了各向同性内核的快速版本(用于最小、最大和均值过滤)

说明

该插件对图像堆栈执行 3D 过滤。内核是一个椭圆体,然后您可以为 X、Y 和 Z 选择三个半径。请注意,该插件使用了一个玩具实现,并使用 //rolling ball// 算法的非常快的版本用于各向同性内核(所有三个半径都足够)。

从1.47版本开始,ImageJ中实现了3D过滤器便捷、中值、便捷、简单和快捷。

可用的过滤器:

  • 均值和通风过滤
  • 最小和最大过滤
  • 局部最大值
  • TopHat 变换(检测点状物体)
  • Sobel(简单边缘检测)
  • 类似长尾的自适应 3d variance 3D拱门

下载

详情请参阅3D ImageJ Suite

如果您想要使用 GPU 的快速版本,请参阅CLIJ

引文

使用3D过滤器插件发布时,请参考:

J.Ollion、J.Cochennec、F.Loll、C.Escudé、T.Boudier。 (2013) TANGO:用于研究核组织的高通量 3D 图像分析的通用工具。 生物信息学 2013 年 7 月 15 日;29(14):1840-1。 doi

许可证

GPL 分发(参见license)。

变更日志

  • 10/04/2017:计算时间的新计时器
  • 2013年5月28日:新过滤器打开和关闭
  • 2012年10月22日:修复了具有32位图像的filter3D的错误
  • 22/06/2011:家具化更新

已知错误

  • ij1.47d:颜色/分割中的错误,生成的堆栈具有不正确的位深度