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成像平台有两个与 ImageJ 相关的目标：使 ImageJ 宏可 CellProfiler 管道中的模块进行访问，莲花 CellProfiler 管道可作为 ImageJ 中的宏执行。调用我们Bio-Formats库集成到 CellProfiler 中以读取和写入的格式。
ImageJ / CellProfiler 协作的不同点在于 CellProfiler 是用 Python 编写的，并使用与 Jython 不兼容的库，因此 CellProfiler 似乎无法在 ImageJ 进程中运行，并且无法轻松访问 Bio-Formats。但我们做到了。我们正在开发自己的技术，使用 JNI 一起运行 Python 和Java，并且在弥合差距方面取得了相当大的成功。这次合作的目标是展示这种集成，并演示如何将其他工具链接到 ImageJ，尽管存在明显的语言障碍。
