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2016-07-21 - KNIME 图像处理黑客马拉松

从2016年7月5日星期二到2016年7月14日星期四，University of Konstanz的Curtis Rueden在KNIME Konstanz Regional Office举办了hackathon的§§§5§§ §会议，以开发KNIME图像处理扩展以及基础ImageJ Ops库，以及其他支持技术，例如ImgLib2、ClearVolume和BigDataViewer。

时间轴

下图说明了每个人都在现场的情况：

/media/news/2016-knime-hackathon-timeline.png <!– The above image was rendered by MediaWiki. Original data, as converted, follows:

Preset = TimeHorizontal_AutoPlaceBars_UnitYear 图像大小 = 宽度:600 颜色= id：c01 值：蓝色 id：c02 值：红色 id：c03 值：绿色 id：c04 值：黑色 id：c05 值：洋红色 id：c06 值：青色 id:c07 值:yelloworange id:c08 值:skyblue id：c09 价值：深红葡萄酒 id:c10 值:oceanblue id：c11 值：紫色 id:c12 值:powderblue id:c13 值: 珊瑚 id:c14 值:redorange id:c15 值:kelleygreen id：c16 值：橙色 id：c17 值：浅紫色 id：c18 值：tan2 id:c19 值:灰色(0.3) id:c20 值:蓝色 id：c21 值：红色 id：c22 值：绿色 id：c23 值：黑色 id：c24 值：洋红色 id:c25 值:青色 id:gridLine 值:gray(0.5) id:gridCanvas 值:gray(0.8) 背景颜色=出售：gridCanvas 期间 = 从：5 到：14 ScaleMajor = 单位：年增量：1 开始：5 网格：白色 线数据 = at:5 颜色:gridLine 层:back width:0.5 at:6 颜色:gridLine 图层:内部宽度:0.5 at:7 颜色:gridLine 图层:内部宽度:0.5 at:8 颜色:gridLine 图层:内部宽度:0.5 at:9 颜色:gridLine 图层:内部宽度:0.5 at:10 颜色:gridLine 图层:内部宽度:0.5 at:11 颜色:gridLine 图层:内部宽度:0.5 at:12 颜色:gridLine 图层:内部宽度:0.5 at:13 颜色:gridLine 图层:内部宽度:0.5 at:14 颜色:gridLine 图层:内部宽度:0.5 条形数据= 账号：黑客 数据=绘图 宽度：15 字体大小：M 文字颜色：白色 对齐：左 译文：来自 班次：(4,-4) 颜色：黑色 酒吧集：黑客 颜色：c01 来自：11 到：14 文本：“Tim-Oliver Buchholz (UniKN)” 颜色：c02 来自：8 到：9 文本：“Joshy Cyriac（USB，4Quant）” 颜色：c03 来自：7 到：13 文本：“理查德·多曼德 (RVC)” 颜色：c04 来自：7 到：10 文本：“Kevin Mader (4Quant, ETHZ)” 颜色：c05 来自：7 到：10 文本：“Simon Schmid (UniKN)” 颜色：c06 来自：7 到：9 文本：“Marcel Wiedenmann (UniKN)” 颜色：c07 来自：7 到：8 文本：“Jan Eglinger (FMI 巴塞尔)” 颜色：c08 来自：5 到：13 文本：“凯尔·哈林顿 (HMS)” 颜色：c09 来自：6 到：12 文本：“Curtis Rueden（威斯康辛大学麦迪逊分校）” 颜色：c10 来自：5 到：14 文字：“Christian Dietz (UniKN)” 颜色：c11 来自：5 到：14 文本：“Patrick Winter (UniKN)” 颜色：c12 来自：5 到：14 文本：“Tobias Pietzsch (MPI-CBG)” 颜色：c13 来自：5 到：14 文本：“Ulrik Günther (MPI-CBG)” 颜色：c14 来自：5 到：14 文字：“Martin Horn (UniKN)” 颜色：c15 来自：5 到：14 文本：“Andreas Burger (UniKN)” 颜色：c16 来自：5 到：14 文字：“Alexander FIllbrunn (UniKN)” 颜色：c17 来自：5 到：14 文本：“David Hörl（慕尼黑大学 / 柏林 MDC）” 颜色：c18 来自：5 到：13 文字：“Jonathan Hale (UniKN)” 颜色：c19 来自：5 到：12 文字：“Nico Hoffmann (TUD)” 颜色：c20 来自：5 到：9 文本：“Stefan Helfrich (UniKN)” 颜色：c21 来自：5 到：8 文本：“Cyril Mongis（海德堡大学）”

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画廊

黑客！ 黑客！
晚餐时的黑客 晚餐时的黑客
<img alt="Christian Birkhold (Dietz)" src="/media/news/hackathon-2016-konstanz-rueden.jpg" width="380" /> Christian Birkhold (Dietz)
<img alt="Richard Domander" src="/media/news/hackathon-2016-konstanz-harrington.jpg" width="380" /> Richard Domander
<img alt="Kyle Harrington" src="/media/news/hackathon-2016-konstanz-domander.jpg" width="380" /> Kyle Harrington
<img alt="Christian Birkhold (Dietz)" src="/media/news/hackathon-2016-konstanz-hoerl.jpg" width="380" /> Christian Birkhold (Dietz)
<img alt="David Hörl和Kyle Harrington" src="/media/news/hackathon-2016-konstanz-dietz-and-rueden.jpg" width="380" /> David Hörl和Kyle Harrington
<img alt="Curtis Rueden和Stefan Helfrich" src="/media/news/hackathon-2016-konstanz-harrington-and-gunther.jpg" width="380" /> Curtis Rueden和Stefan Helfrich
<img alt="Ulrik Günther和Richard Domander" src="/media/news/hackathon-2016-konstanz-helfrich-and-pietzsch.jpg" width="380" /> Ulrik Günther和Richard Domander
KNIME 3.2：寿司版 KNIME 3.2：寿司版
反重力盐瓶！ 反重力盐瓶！

黑客马拉松进展

克里斯蒂安·迪茨

  • 继续研究 KNIME SciJava 节点和 KNIME SciJava 脚本

理查德·多曼德

凯尔·哈林顿

-添加了3D网格体素化到imagej-ops#413 (matrixType)

斯特凡·赫尔弗里奇

  • MatrixType 和 VectorType 的原理验证实现 (imagej-ops#419)
  • 允许在 Ops 中使用全局阈值作为本地阈值
  • 改进过滤器的默认 OOBF 处理
  • 启动基于JavaScript的图像查看器，使用BigDataViewer图块服务器

柯蒂斯·鲁登

  • 在使用Nil（又名“typed null”）对象操作改进方面取得了重大进展——imglib2#27的nil分支的工作发射中；master上已做好准备工作（1、imagej-ops#413）
  • 清理了ImageJ Ops 的依赖；特别是，使用 SCIFIO 进行 I/O，而不是 ImageJ 1.x 和 AWT (2)
  • 帮助清理Tobias Pietzsch的“替换替换空间和操作”PR (scijava/scripting-kotlin) -创建了一个（尚未运行）Kotlin SciJava 脚本引擎 (imagej-ops#415)

技术讨论

  • ImageJ 用户界面的未来：ImageJFX？克尼姆？ JavaScript + RESTful 图像服务器？
  • JVM上的语言：使用Scala、Kotlin和/或Groovy作为未来的SciJava组件