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2016-01-29 - KNIME 图像处理黑客马拉松

从2016年1月11日星期一到2016年1月22日星期五，University of Konstanz的Kyle Harrington在KNIME Konstanz Regional Office的hackathon中接待了约30名开发人员，正在开发KNIME图像扩展处理以及基础的ImageJ Ops库，以及其他支持技术，例如§§7§§§和ClearVolume。

时间轴

下图说明了每个人都在现场的情况：

/media/news/knime-hackathon-timeline.png <!– The above rendered image was copied from the old MediaWiki. Original timeline data, as converted, follows.

Preset = TimeHorizontal\_AutoPlaceBars\_UnitYear 图像大小 = 宽度:600 颜色= id：c01 值：蓝色 id：c02 值：红色 id：c03 值：绿色 id：c04 值：黑色 id：c05 值：洋红色 id：c06 值：青色 id:c07 值:yelloworange id:c08 值:skyblue id：c09 价值：深红葡萄酒 id:c10 值:oceanblue id：c11 值：紫色 id:c12 值:powderblue id:c13 值: 珊瑚 id:c14 值:redorange id:c15 值:kelleygreen id：c16 值：橙色 id：c17 值：浅紫色 id：c18 值：tan2 id:c19 值:灰色(0.3) id:c20 值:蓝色 id：c21 值：红色 id：c22 值：绿色 id：c23 值：黑色 id：c24 值：洋红色 id:c25 值:青色 id:c26 值:yelloworange id:c27 值:skyblue id:c28 值: 枣红色 id:c29 值:oceanblue id:gridLine 值:gray(0.5) id:gridCanvas 值:gray(0.8) 背景颜色=出售：gridCanvas 期间 = 从：11 到：23 ScaleMajor = 单位：年增量：1 开始：11 网格：白色 线数据 = at:11 颜色:gridLine 图层:内部宽度:0.5 at:12 颜色:gridLine 图层:内部宽度:0.5 at:13 颜色:gridLine 图层:内部宽度:0.5 at:14 颜色:gridLine 图层:内部宽度:0.5 at:15 颜色:gridLine 层:back width:0.5 位置：16 颜色：gridLine 图层：内部宽度：0.5 at:17 颜色:gridLine 图层:内部宽度:0.5 at:18 颜色:gridLine 层:back width:0.5 at:19 颜色:gridLine 图层:内部宽度:0.5 at:20 颜色:gridLine 图层:内部宽度:0.5 at:21 颜色:gridLine 图层:内部宽度:0.5 at:22 颜色:gridLine 图层:内部宽度:0.5 位置：23 颜色：gridLine 图层：内部宽度：0.5 条形数据= 账号：黑客 数据=绘图 宽度：15 字体大小：M 文字颜色：白色 对齐：左 译文：来自 班次：(4,-4) 颜色：黑色 酒吧集：黑客 颜色：c01 来自：18 到：21 文本：“Ulrik Günther (MPI-CBG)” 颜色：c02 来自：18 到：20 文本：“Tobias Kötter (KNIME)” 颜色：c03 来自：18 到：20 文本：“Björn Lohmann (KNIME)” 颜色：c04 来自：16 到：22 文本：“Eike Heinz (UniKN)” 颜色：c05 来自：14 到：22 文本：“Kevin Mader (ETH/4Quant)” 颜色：c06 来自：14 到：21 文本：“Thomas J. Re (UniSpitalBasel)” 颜色：c07 来自：14 到：18 文本：“Julianus Pfeuffer (EKUT)” 颜色：c08 来自：13 到：21 文本：“罗伯特·哈斯 (MPI-CBG)” 颜色：c09 来自：13 到：21 文本：“Florian Jug (MPI-CBG)” 颜色：c10 来自：13 到：21 文本：“Tobias Pietzsch (MPI-CBG)” 颜色：c11 来自：13 到：21 文字：“Loic Royer (MPI-CBG)” 颜色：c12 来自：13 到：17 文本：“Tim-Oliver Buchholz (UniKN)” 颜色：c13 来自：13 到：17 文本：“Temesgen H. Dadi (FU Berlin)” 颜色：c14 来自：12 到：22 文本：“Christian Dietz (UniKN)” 颜色：c15 来自：12 到：22 文本：“Alexander Fillbrunn (UniKN)” 颜色：c16 来自：12 到：22 文字：“Jonathan Hale (KNIME)” 颜色：c17 来自：12 到：22 文本：“Stefan Helfrich (UniKN)” 颜色：c18 来自：12 到：22 文本：“Mark Hiner (UniWisc)” 颜色：c19 来自：12 到：22 文字：“Martin Horn (UniKN)” 颜色：c20 来自：12 到：22 文本：“David Kolb (UniKN)” 颜色：c21 来自：12 到：22 文本：“Ole Ostergaard (UniKN)” 颜色：c22 来自：12 到：22 文本：“Curtis Rueden (UniWisc)” 颜色：c23 来自：12 到：22 文本：“Patrick Winter (UniKN)” 颜色：c24 来自：12 到：21 文本：“Nico Hoffmann (TUD)” 颜色：c25 来自：12 到：19 文字：“Jon Fuller (KNIME)” 颜色：c26 来自：12 到：19 文本：“凯尔·哈林顿 (HMS)” 颜色：c27 来自：12 到：17 文本：“蒂莫·萨克森伯格 (EKUT)” 颜色：c28 来自：12 到：15 文本：“Luis de la Garza (EKUT)” 颜色：c29 来自：12 到：15 文本：“Jan Eglinger (FMI 巴塞尔)”

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黑客马拉松进展

马克·海纳

  • 研究
    • Investigated improvements to Ops generic parameter matching. The problem is complex, but a solution is in the works.
    • Explored possible Ops matching performance improvements (scijava/pom-scijava@022a7bea)
    • Improved Jenkins jobs to build SNAPSHOT javadoc for all core SciJava components (scijava, scifio, imglib2 and imagej). as requested by Kyle Harrington (2, 1, alias-for-img)
  • 审核和合并 PR（1、2、3、4、5、6、7、8、9）
  • 结对编程错误修复和增强功能：
  • 为imglib2-roi 实现了连续（超）曲面体、曲面和二元运算。
  • 为ImageJ/Fiji开发“Data Explorer”原型
    • holding various data structures like images, labelings, measurements (tables) and plots. The structure is persistent, so closing windows does not delete the items from the tree. They can be reopened.
    • 2D/3D/nD? data is handled equally, so selecting/deleting labels for/from further analysis according to their properties is possible more or less independent from the labels dimensionality.
    • Measurements on labels is based on imagej ops()

      帕特里克·温特

  • org.knime.cluster KNIME中资源集成的抽象开源，使社区能够轻松实现自己的资源连接器
  • 包装的元节点（又名子节点）现在可以在集群中运行，并且还支持输入分割数据（以前的元节点实现不是这种情况）
  • 作业连接器的实现变得更加简单，因为我们消除了作业单个和大小为 1 的分块作业的区别
  • 旧实现中的许多错误修复，以及org.knime.core中的修复（主要涉及子节点）

乌尔里克·冈瑟

托比亚斯·皮茨奇

斯特凡·赫尔弗里奇

未来的方向