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TrackMate 扩展

TrackMate由于其自定义结构并且可以扩展。 我们和其他一些人还开发了其他依赖于 TrackMate 并扩展其功能的插件。 我们在这里记录了其中一些。

  • TrackMate Helper：用于测量跟踪性能并根据单粒子跟踪挑战和细胞跟踪挑战中定义的指标优化跟踪设置的工具。

  • Varun Kapoor 的TrackMate ONeat，以及可以基于机器学习过程检测细胞分裂的扩展。

  • TrackMate CSV Importer：用于将检测结果从 CSV 表导入 TrackMate 的插件。

  • Find Maxima detector：使用ImageJ的“查找顶部”命令来检测对象的检测器。作者：托尔斯滕·瓦格纳。