来自斐济的 Rois 生成面具
安装
激活Rois的面具更新站点（参见Activating an update site）。
或者，如果没有斐济更新程序，您可以下载存储库的内容，单击绿色按钮code，然后选择Download ZIP。
解压缩文件，将 Fiji.app 目录拖放到包含 Fiji 安装的目录中（即包含您自己的 Fiji.app 的目录中）。
这将自动将文件复制到正确的位置。
在这两种情况下，请确保重新启动斐济。
然后，这些插件就可以在菜单编辑>选择的底部找到，来自Rois边界的面具。
应用
这些插件有助于从大型数据集的 ROI 概述的图像区域生成触发器。
例如，它可用于生成地面实际情况分割报表。
带注释的图像可以是单一平面图像或具有单一尺寸的堆栈，HYPERSTACKS 目前不支持。
该插件应在注释图像中的所有 ROI（存储在 RoiManager 中）或堆栈的所有图像后执行。
可以注释单个图像或堆栈（或虚拟堆栈）中的多个图像。在后一种情况下，Rois 的 Z 位置用于将它们与相应的图像相关联。缩略图堆栈中的每个生成一个掩码。
有 2 个用于生成的插件：
-
二进制编译码
生成的蒙版为黑色（像素值0），而由rois勾勒出的区域则等于白色像素（像素值255）。
因此，重叠的 ROI 将合并为麦克风中的单个“白色荧光”。 -
多类/凹陷码
该插件使用group attribute of ROIs来注释属于相同的“对象类”的区域，组织……
ROI 被转向与 ROI 组相对应的像素值的区域。结果是“大象模型”，其中相同组的对象/组织具有相同的像素值。
具有相同组属性的重叠ROI将合并为具有相同像素值的单体溶液。
然而，具有不同组属性的重叠ROI将被分配最后一个“较差”ROI的像素值，即RoiManager中最底部的ROI。
为了实现此类语义掩码的可视化，该插件会自动设置“Glasbey on dark”LUT。
当打开这样保存的触发器选择时，可能不会自动查找LUT，而使用经典的灰色LUT不允许正确地可视化触发器。
在本例中，选择 imageJ 菜单_图片 > 查找表_中的 Glasbey LUT 之一。
文件名后缀
将蒙版另存为图像文件时，可以在文件名中添加可选的后缀，例如，如果您将蒙版保存在与图像相同的目录中。
示例：
原始.tiff
标记后缀 -mask 和 png 扩展名，占码可用
原始掩码.png
