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雅各布

雅各普

This page describes Just Another Colocalization Plugin, not the Java Constraint Programming solver.

此插件是良好的本地化工具的编译。

作者

Fabrice P. Cordelières,波尔多影像中心(法国)。 Fabrice.Cordelières at gmail dot com Susanne Bolte,IFR 83,巴黎(法国)。 Susanne.Bolte 在 upmc.fr

##特点

JACoP 允许:

计算一组常用的共定位指标:

  • 皮尔逊系数
  • 重叠系数
  • k1 和 k2 系数
  • 曼德斯系数

生成常用的可视化:

  • 细胞荧光图

可以访问最近发布的方法:

  • Costes的自动阈值
  • 李的ICA
  • 成本的随机化
  • 基于对象的方法(2种方法:中心之间的距离和中心消费者重合)

所有方法均适用于 3D 数据集。

说明

JACoP 已根据用户反馈完全重写。该界面经过重新设计,基于独特的 Swing 框架,提供对所有选项的完全访问。

JACoP v2.0: The new interface

它包括一个“允许缩放/重置按钮”,用户并排设置多个选定的图像,自动调整缩放。对于选定的最大化方法,通过将其标题变成红色来突出显示相应的选项卡,从而将用户的注意力集中在设置的选项上。

参考文献/引文

使用当前插件进行发布时,请参阅我们的评论(见下文)、此网页,当然还有 ImageJ。如果您将论文副本发送到我们的两个电子邮件地址,我们将不胜感激!

doi:10.1111/j.1365-2818.2006.01706.x

JACoP v2.0 于 2009 年 11 月在第二届 ImageJ 用户和开发者大会上发布。与该插件相关的会议记录可在 1 中找到。

安装

JACoP_.jar下载到ImageJ的Plugins文件夹中,重新启动ImageJ并使用Plugins菜单中的“JACoP”命令即可。

下载

这里提供插件:JACoP_.jar

许可证

该程序是免费软件;您可以根据自由软件基金会发布的 GNU 通用公共许可证的条款重新分发和/或许可证它;的版本 3,或(由您提供)任何更高版本。分发此程序的目的是它有用,但不做任何保证;甚至没有适销性或特定用途适用性的默示保证。有关更多希望详细信息,请参阅 GNU 通用公共许可证。您应该随程序该一起收到 GNU通用许可证公共副本。如果没有,请参阅https://www.gnu.org/licenses/

版权所有 (C) 2006 Susanne Bolte 和 Fabrice P. Cordelières

变更日志

2.0(2008年7月11日):

  • 新界面:一个窗口显示所有选项
  • JACoP 现在完全可录制宏
  • 添加了基于对象的方法
  • 添加了“允许缩放/重置按钮”,并排设置两个选定的图像,自动适应缩放。

2.1(2010年1月4日):

  • 修复了对图像应用阈值时导致曼德斯系数计算错误的错误。

2.1.1(20/08/2010):

  • 修复了从宏调用函数时有关基于距离的共定位的错误。