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不平衡

这是一组 ImageJ 插件,用于处理从电子显微镜获取的图像。目前主要关注 SEM 图像,但我将继续致力于简化 SEM 和 TEM 数据的图像处理。

组件和功能

单击下面的链接可了解有关每个工具的更多信息。

  1. [ SEM FEI metadata and scale ]从tiff标签读取FEI SEM采集元数据,并根据像素大小设置图像比例。
  2. [ SEM FEI databar cut ]从FEI SEM图像中剪切数据条,然后将图像和数据条保存为单独的文件。(页面准备中)
  3. [ SEM JOEL Scale ]根据与SEM图像关联的.txt文件中存储的像素大小设置比例图像。
  4. [ SEM ZEISS metadata scale ] 从 tiff 标签读取 ZEISS SEM 采集元数据,并根据像素大小设置图像比例。
  5. [ SEM Hitachi metadata scale ] 即将推出…
  6. [ Image feature measurement annotation ]测量并标记特征尺寸。它在确定图像中注释线工具的长度并导出测量结果。
  7. [ Flat field correction ]对图像文件夹应用平场校正以进行大映射面积,以减少拼接后的国际象棋图案。 (页面准备中)
  8. [ TEM .ser .dm3 folder export ] 此工具将文件夹中的 TIA EM 图像.ser文件和 Gatan .dm3文件转换为 TIFF 格式。

##安装

###通过ImageJ更新程序安装

  1. Fiji (Fiji Is Just ImageJ) 应安装在您的计算机上。

2.再次点击PluginsMacrosInstall…打开Updater。如果是第一次更新Fiji,可能需要一些时间来下载更新文件,并且可能还需要重新启动Fiji几次。完成后,单击HelpUpdate…即可显示ImageJ更新程序窗口。

emtool-01

3.点击“管理更新站点”。

emtool-02

4.找到并勾选“EM工具”,URL“https://sites.imagej.net/IMBalENce/”。

5.如果未显示更新站点,您可以通过单击Close手动添加站点。输入名称“EM tool”,URL“https://sites.imagej.net/IMBalENce/”

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6.单击“管理更新站点”窗口上的Add update site,然后单击ImageJ Updater窗口上的Apply changes

7.更新完成后,重新启动Fiji。您应该能够在顶部工具栏看到安装的插件“EM Tool”。

手动安装

如果您选择使用其中一个插件,可以按照以下步骤操作:

1.这些宏脚本的来源代码可以查看on GitHub

2.下载您想要的脚本。

  1. .ijm文件保存在ImageJ应用程序中的所需位置。

  2. 转到HelpUpdate…宏添加,或将.ijm文件拖放到ImageJ/Fiji上。