视觉（即共同配准）2D 图像。
说明
“健康数据科学 (DS4H) 彩色图像”是一个用户界面的工具，ImageJ/Fiji 插件免费提供。借助 DS4H 图像对齐，只需单击几下即可定义一些清晰的参考标记，从而轻松彩色（即共同配准）2D 图像。
通过角点对齐
所实现的最小二乘法自动逼近数学超定系统的解，从而定义配准矩阵，用于匹配不同的图像。它还考虑了对象膨胀/收缩时的旋转和比例变化。最后，提供了一个用于精细顺序的迭代子程序，以轻松达到非常好的然后图像配准质量。
自动对齐
DS4H-IA 提供了基于光纤光栅 2D 显微镜图像的机会。设计的方法著名的 BRIEF 算法。简单来说，从 OpenCV 库中提供的开源代码开始，我们实现了一个基于星探测器的解决方案，星探测器是一种用于定义可靠角点的通用算法，然后由简要使用来生成局部图像。然后比较连接，然后使用定义投影矩阵之前的过滤，然后用于前置后续图像。最后，所有输入图像在 z方向上对准的多通道堆栈作为输出提供。此外，它可以重新设置 DS4H-IA 的输入，以：(a) 修正错误的对准，或 (b) 手动对准自动配准方法不易处理的图像（例如，分析读出数据集时的 DIC 冷冻图像）。在这些情况下，半自动配准方式比鱼线配准方式更精确，大多数图像都使用 BRIEF 自动对准的，但其中一些图像还通过用户手动定义的角点进行配准。
实施
DS4H 彩色图像已在 Java 中作为 ImageJ 和 Fiji 的插件实现。它适用于“.svs”文件，还适用于 Bio-Formats 库中包含的所有医学逻辑格式。
下载
DS4H 图像预览可免费提供，并附有示例数据集和视频教程。
要安装 DS4H 图像对齐，请按照视频教程中报告的说明进行操作。基本上，您将 DS4H 图像对齐“.jar”文件复制到 ImageJ/Fiji 的插件文件夹中。
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https://github.com/UniBoDS4H/IA/releases,处的“.jar”文件将被复制到 ImageJ 或 Fiji 的插件文件夹中，适用于 Mac（Intel 或 ARM 芯片）、Windows、Linux。
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Sample dataset (1 MB)，其中有一些可用于测试 DS4H 图像扫描的图像。
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视频教程，了解如何使用 DS4H 图像对齐。
参考
请在科学著作中使用/引用“DS4H图像成像”时，引用：
许可证
版权所有 (C) 2019，健康数据科学 (DS4H) 小组。版权所有。
图像扫描和图像扫描网站上提供的材料已获得以下许可：GNU 通用许可证版本 3
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修改程序是免费软件：您可以根据任何自由软件基金会发布的 GNU 通用公共许可证（的第 3 版）或（由您选择）更高版本的条款重新分发和/或它。
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分发此程序的目的是希望它有用，但不提供任何保证；甚至没有适用性或特定用途适用性的默许保证。有关更多详细信息，请参阅 GNU 通用公共许可证。
##致谢
我们感谢所有为该项目提供帮助的大学生。特别是：
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(2022) Marco Edoardo Duma，博洛尼亚大学科学学院，理学士论文，标题：DS4H 图像扫描：模数排列多模式自动考虑固体变形。主管：安东内拉·卡纳罗。联合导师：Filippo Piccinini、Giovanni Martinelli、Gastone Castellani。论文答辩：2022年5月27日
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(2019) Stefano Belli，意大利博洛尼亚大学计算机科学硕士研究生，电子邮件：stefano.belli4@studio.unibo.it
联系我们
健康数据科学（DS4H）小组：
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Antonella Carbonaro，意大利博洛尼亚大学计算机科学与工程系 (DISI)，电子邮件：antonella.carbonaro@unibo.it
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Filippo Piccinini，Istituto Scientifico Romagnolo per lo Studio e la Cura dei Tumori (IRST) IRCCS，Meldola (FC)，意大利，电子邮件：filippo.piccinini@irst.emr.it
