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CIPMM 插件

欢迎!

这是萨尔大学综合生理学和分子医学中心 (CIPMM) 分子生理学系的官方插件存储库。

目前,该存储库包含一个名为“LRoi”的插件,它可以帮助您创建一组相同大小的 ROI。

安装

您只需将以下更新站点添加到 ImageJ 更新程序即可安装 LRoi(以及所有未来的插件):

满足

LRoi 的主要目的是沿着分布线创建同等大小的感兴趣区域 (ROI)(称为 LRoi)。要创建多个 ROI,只需选择 ImageJ 的图像稀疏工具并在打开的相应或图像堆栈上的稀疏一条线上。

Linetool Seedingline

打开 LRoi 插件并指定要创建的 ROI 数量、ROI 宽度和高度。

Lroi example Lroi length

ROI 高度用于调整种子行的长度。它的中心点。这可以开始绘制辅助工具,因为有时获得不同的特定长度的线可能很困难。LRoi 可以确保您的播种线指定精确的长度。

然后,这条线被解释为您想要使用指定宽度创建的 ROI 数量。在我们的示例中,我们沿着 350 µm 的撒播线创建 25 个 ROI,每个 ROI 的宽度为 50 µm。这将导致每个 ROI 的面积为 14 µm x 50 µm = 700 µm。

Rois example

在此示例中,我们创建了 25 个 ROI,每个 ROI 的面积为 700 µm²。

高级选项

除了沿着分布线创建同等大小的 ROI 之外,LRoi 还允许创建垂直于该线的 ROI、十字形、常规网格或自定义大小的网格。

单击 LRoi 窗口中的相应队列即可激活这些高级 ROI 创建方案。 ROI 网格由它们应包含的像素数量(如果将网格大小定义为 8,则每个网格单元将会 8 x 8 像素大)。

另一方面,自定义 ROI 网格是通过指定所需 ROI 网格的列数和行数来定义的。