中心粒子重合 (CPC) 是一个 ImageJ/Fiji 插件，用于基于对象的共定位分析。当分段对象的质心占据另一个通道中的分段对象内时，CPC 将分段对象分类为重合，并且它还报告相互的“包含”关系：有多少个伙伴对象质心则每个对象内。这使得分割与共定位分开，因此，对象可以来自 StarDist、Cellpose、阈值、手动 ROI 集或生成标签或 ROI .zip文件的任何其他工作流程。
安装
CPC通过ImageJ更新站点分发：
需要安装它：
1.启动斐济。 2.选择Help › Update…。 3.点击“管理更新站点”。
- 启用中心粒子重合（CPC）更新站点（如果已注册），或单击添加未注册站点并使用：
- 姓名：
Center-Particle-Coincidence - 网址：
https://sites.imagej.net/Center-Particle-Coincidence/5.应用更改并重新启动Fiji。
- 姓名：
重新启动后，从以下位置运行CPC：
Plugins > CPC
CPC 的作用
CPC 比较跨渠道的架构对象。对于源标签图像中的每个对象，它读取源对象质心位置处的目标标签图像。如果该位置突出目标对象内，CPC 将源对象报告为与该目标对象重合。
CPC仍在运行倒数质心测试，以便用户可以从另一个方向的婚姻：
- 与B共定位：此A对象的质心标志着B对象内部。
- 包含 B：一个或多个 B 对象质心该该 A 对象内部。
小物体可以与大物体共定位而不包含它，而大物体可以包含多个伴侣质心，即使它自己的质心不代表任何一个伴侣物体内部。
输入
CPC支持多种输入模式：
- 标签图像：打开或文件支持的标签/对象映射。每个对象都由一个非零整数标签表示。
- ROI集：参考Image加上ImageJ ROI
.zip文件。
如果原始强度图像可用，CPC 可以使用强度加权质心而不是几何质心。原始图像必须与相应标签图像的尺寸相匹配。
输出
CPC可生产：
- 每个对象的成对结果表
- 标记统计和百分比的组成对汇总表
- 全体成员“共定位”结果和相互“构成”计数
- 多目标组合摘要显示每个源对象与哪些目标通道一致
- 用于目视检查的可选质心标签图
- 自动保存带CSV表和地图图像的文件夹输出
启用自动保存后，CPC 保存结果写入 CPC/ 文件夹，其中包含对象表、多目标摘要、地图图像和描述输出的小自述文件。
批处理
批处理…按钮可打开处理多个标签图像的文件夹工作流程。批处理模式支持各级文件夹扫描、文件名正则表达式分组、运行前组预览以及跨组和文件夹的聚合输出表。
方法注释
它回答了两个相关的问题：“这个对象的质心是否填充另一个通道中的对象内部？”和“哪个对象质心填充这个对象内部？”这对于通道独立分割、对象大小不同或标签由不同分割工具生成的工作流程非常有用。
由于CPC使用对象质心，因此用户应检查分割质量并根据数据集的生物学和图像质量选择几何或强度加权质心。
引文
如果您在已发表的作品中使用CPC，请引用已文档的版本。下面的概念DOI始终解析为最新版本：
Malcolm, J. (2026). CPC - Centre-Particle Coincidence [Computer software].
Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.21633355
如果精确的再现性很重要，请引用您运行的 DOI 版本 — v1.5.0 为 10.5281/zenodo.21812272。
