组织分支追踪器

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Logo2 该产品证明了我们 KapoorLabs 的专业知识，我们专注于创建尖端解决方案。我们提供定制的管道开发服务，利用我们先进的计算机视觉和人工智能工具将您的发育生物学问题转化为可发布的数据。利用我们的专业知识和资源来实现端到端解决方案，使您的研究脱颖而出。 注意：这里展示的工具和管道仅代表我们可以实现的一部分。如需超出参考我们图书中所做内容的定制和全面解决方案，请直接与我们联系。团队已准备好提供您所需的专业知识和定制开发，使您的研究更上一层楼。请访问KapoorLabs。

BTrack 是一个 TrackMate 检测器，用于使用 imglib2 的重构实现来跟踪组织分支的生长终止。

安装

1.单击Plugins › Tracking › TrackMate。 2.点击管理更新站点按钮。

在列表中选择BTrack 更新站点。
单击关闭，然后单击应用更改。 5.重启斐济。
读数将显示在 TrackMate 的下拉菜单列表中。
检测后，任何 TrackMate 跟踪算法护士用于第 tracking 支架端点。 8.完成跟踪后的跟踪分析可以使用TrackMate中提供的所有功能来。

满足

组织检测

BTrack 是一种分析分支组织生长的工具。可以使用该梯度分析 2D 延迟/3D 图像。文件格式可以是 Fiji/Bioformats 区别的任何格式（.tif、.nd2、…）。要运行跟踪器，请选择Help › Update…

要使用此检测器，请从 TrackMate 的检测器菜单列表中选择 Btrack。屏幕如下所示 Btrackdetector screen 1

检测面板

单击下一步，如果您使用的是在两个通道中包含原始图像和分割图像的超堆栈，请选择检测器的分割图像通道。单击“预览”查看检测到的端点。该面板如下所示 Btrackdetector screen 2 在我们的example, download from Zenodo中，我们在通道 1 中有分割图像，在通道 2 中有原始图像，初始检测如下所示 Initial detections