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2012-01-19 - Stitching 新版本发布

如果您激活将结果直接写入磁盘和/或仅虚拟打开输入堆栈的选项,您可以仅使用很少的RAM(甚至<1GB)重建任意大小的平铺占用(可以是多通道、现在延迟堆栈)!

以下为全部新亮点列表:

  • 现在支持合成图像和超堆栈(任意数量的通道和时间点)
  • 可以选择将图像逐片直接写入磁盘(显着降低RAM要求)
  • 可以选择将输入图像作为虚拟堆栈打开(显着降低 RAM 要求)
  • 支持不同处理选项的延迟时间
  • 亚分辨率
  • 支持多种不同类型的网格(逐行、逐列、蛇形……)
  • 可以从元图像数据中读取大致的图块位置
  • 基于最终ImgLib

现在 Mini 下两个插件了,它们取代了 Stitching2D/3D 和 Stitch Grid、… Sequence、… Collection 等等。他们被称为:

  • StitchingGrid/Collection Stitching
  • StitchingPairwise Stitching

您可以在斐济维基上找到完整的文档:Image_Stitching

Stitching 作为 Fiji 的一个组件进行部署(只需更新 Fiji),或者您可以将其作为 ImageJ 的独立包下载,其中包括所有必需的库 (11MB):Download…

我感谢所有图书馆的作者和其他帮助我进行拼接的人: Acknowledgements

最后但并非最不重要的一点是,如果您可以引用该插件相关的书籍,那就太棒了:

  • S.普雷比什、S.萨尔菲尔德、P. Tomancak (2009)“平铺 3D 显微图像采集的全局最佳拼接”,生物信息学25(11):1463-1465。 Webpage PDF