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SoC 2009应用

链接 ID

斐济

组名

斐济就是ImageJ

主页网址

https://fiji.sc

电子邮件 公共

fiji-devel@googlegroups.com

说明

斐济代表“斐济就是ImageJ”。 ImageJ是由美国国家卫生研究院赞助的公共领域科学图像处理应用程序。ImageJ运行在Java虚拟机上,因此可以直接访问不同的公共java库。

所有 Fiji 项目的创始人和贡献者都编写过大型插件集合并以 ImageJ 为中心的应用程序。在某些时候,首先将我们的项目合并到一个集中且有组织的框架中,其中包括所有组件的一致且更新的文档。

为了创建斐济,除了我们自己的以 ImageJ 为中心的应用程序之外,我们选择并测试了 ImageJ 存在的数千个开源插件的子集,把它们与几个开源库集成到一个一致的框架中。插件添加了超出常规图像处理的功能,包括图像分割、图像配准、体积的 3D 可视化以及对各种 JVM 支持的脚本语言的支持(其中:javascript、jython、jruby、clojure 和 beanshell)。

斐济作为一个社区得到了各种在图像处理方面拥有既得利益的科学研究机构的支持,包括但不限于霍华德休斯医学研究所Janelia Farm、德累斯顿马克克斯普朗克分子细胞生物学和林肯研究所以及苏黎世大学和苏黎世理工联邦学院的神经信息学研究所。

##您的团队为何申请参与?您希望通过参与获得什么?

有许多任务适合独立的小型项目,这将大大增强斐济的实力。通过GSoC,我们看到了将年轻聪明的人引入我们的项目的机会,利用这些项目社区的人性方面(特别是其绝缘的黑客马拉松)和项目代码库的切入点。

您的小组的公共主要邮件列表是什么?

fiji-devel@googlegroups.com

##您使用什么标准来选择小组成员?请具体咨询

斐济团队的所有潜在导师都必须通过成为至少一个流行 ImageJ 插件的作者来证明自己的能力。这确保他们至少具备 Java、ImageJ API 和社区流程的中级知识。它还保证了导师不会“离开”,并且在学生不幸“离开”的情况下,他们也能完成项目。

您的团队以前参加过吗?如果是这样,请总结您的参与以及过去的成功和失败

不。斐济项目还不到两年,所以还没有太多的机会。

如果您的团队之前没有参加过,您过去是否申请过?如果是这样,以童话方式参与?

我们过去没有申请过,但我们的导师已经有两次担任 Git 项目导师的经验。

您的项目使用什么许可证?

GPL (GNU Public License), version 2

##您的创意页面的URL是什么?

SoC2009Ideas

##您团队的主要开发邮件列表是什么?

fiji-devel@googlegroups.com

您希望组织的贡献者使用什么应用程序模板

SoC2009Template

对于消失的贡献者,您有什么计划?

[又名消失的学生]

如果学生在没有完成项目的情况下放弃,斐济社区将继续表彰学生离开的地方并在没有学生的情况下继续工作。

导师将与学生一起设置项目,将中断小块(里程碑),这些小块可以在今天的期限内完成项目。我们将建议并鼓励学生在学习过程中记录他们的代码,而代码文档(简洁而完整)将是评估的方面。适当的文件涉及任何新学生或任何斐济社区成员能够从学生离开的地方继续项目。

对于消失的会员,您有什么计划?

[又名消失的导师]

约翰内斯·辛德林(Johannes Schindelin)和阿尔伯特·卡多纳(Albert Cardona)是这些导师的科学研究工作都与斐济的软件应用程序直接。聚集了新成员并进一步发展斐济符合他们的利益。最近,他们都在 GSoC 项目外部指导学生。

万一任何导师必须离开,我们将安排另一位导师介入。斐济社区有很多人参与该软件的各个方面,他们很乐意接受指导,帮助学生完成他们的项目。很有可能,这样的新导师已经通过邮件列表以及对项目活动的直接兴趣和认识学生。

您将采取哪些步骤来鼓励贡献者在计划之前、期间和之后与您的项目社区互动?

[又名学生]

出于必要,斐济团队在邮件列表和 IRC 上建立了良好的沟通:成员居住在不同的国家。这种沟通文化将帮助学生不再害怕寻求帮助并报告他们的进展。

另外,导师将确保在 IRC 上保持“办公时间”,如果学生自己不这样做,通常会尝试开始对话。

将要求经常进行指导和简要的状态更新,以便学生不会失去注意力,并且如果(地理上)可能,导师将优先与学生会面。

项目结束后,您将如何确保您接受该项目的贡献者?

自2007年6月以来,斐济小组每年举办3至4次会议,我们计划于2009年在三个不同的国家举办3次会议。这样的会议黑客马拉松:我们一起坐在编码,交换数据图像进行测试,通常还会为用户举办三次研讨会。

我们将邀请并资助学生参加暑期后的黑客马拉松。这些黑客马拉松的环境积极保持友好和轻松,同时关注所有成员都试图解决的各种科学问题。

备份组织管理员?

约翰·内斯·辛德林和帕维尔·托曼恰克