本页总结了ImageJ 1.x和ImageJ2 API基本操作的翻译。基于 Robert Haase、科学计算设施、MPI-CBG 德累斯顿的工作。
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启动ImageJ
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new ij.ImageJ();
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ImageJ ij = new net.imagej.ImageJ();
ij.ui().showUI();
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显示图像
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小鬼是一个图像加号目的
imp.show();
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ij.ui().show(imp);
ImageJFunctions.show(imp);
ImageJFunctions.wrap(imp,"Image").show();
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检索活动图像对象
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ImagePlus imp = IJ.getImage();
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脚本参数（与数据集, 图像加号， ETC。）：
#@ Img image
在Java代码中：
@Parameter
private Img image;
使用图像显示服务:
Dataset image = ij.imageDisplay().getActiveDataset();
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打开图像文件
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IJ.openImage()返回一个图像加号对象而不显示。
ImagePlus imp = IJ.openImage(urlOrFilePath);
imp.show();
IJ.open()自动显示图像而不返回图像加号.
IJ.open(urlOrFilePath);
ImagePlus imp = IJ.getImage();
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使用IO服务:
Object image = ij.io().open(urlOrFilePath);
使用数据集IO服务（为了类型安全）：
Dataset image = ij.scifio().datasetIO().open(urlOrFilePath);
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保存图像文件
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IJ.saveasTiff(imp, "/path/to/image.tif")
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使用IO服务:
ij.io().save(dataset, "/path/to/image.tif");
使用数据集IO服务:
ij.scifio().datasetIO().save(dataset, "/path/to/image.tif");
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转换图像类型
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从 ImgLib2 转换图像对象 ImageJ图像加号目的：
ImagePlus imp = ImageJFunctions.wrap(img,"Title");
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从 ImageJ 转换图像加号ImgLib2 的对象图像目的：
Img img = ij.convert().convert(imp, Img.class);
Img<T> realImg = ImageJFunctions.wrapReal(imp);
Img<FloatType> floatImg = ImageJFunctions.convertFloat(imp);
Img<FloatType> realImg2 = ImageJFunctions.wrap(imp);
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显示地区
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imagePlus.setRoi(roi);
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Img<BitType> mask; // = ...
Roi roi = ij.convert().convert(mask, Roi.class);
imagePlus.setRoi(roi);
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运行插件
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IJ.run(imagePlus,"Normalisation","");
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ij.command().run(ImageNormalizerIJ2Plugin.class, true,
"input", img, "ij", ij);
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定义插件
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public class ImageNormalizerPlugin implements PluginFilter {
...
}
In 资源/plugins.config:
Plugins>Filtering, "Normalisation", NormalizerPlugin
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@Plugin(type = Command.class, menuPath = "Plugins>Normalization")
public class ImageNormalizerIJ2Plugin implements Command {
...
}
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另请参阅
on GitHub
